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http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/
SGE作業調度系統的簡介
一、常見的幾種作業調度系統
Condor是一個資源管理和作業調度系統,是來自Wisconsin-Madison大學的研究項目。充分利用工作站的空閑時間是Condor的最顯著特征。Condor管理的機群由網絡中的工作站組成,工作站可以自願加入或退出。Condor監測網絡中所有工作站的狀態,一旦某台計算機被認為空閑,便把它納入到資源池中。在資源池中的工作站被用來執行作業。
Sun網格引擎(Sun Grid ,SGE)是一種來自於SUN Microsystem的分布式資源管理和調度系統,它用來在基於UNIX的計算環境中優化軟件和硬件資源的使用。SGE能用於查找資源池內的閑置資源並利用這些資源;它同樣用於通常的一些事務中,例如管理和調度作業到可用資源中。
負載共享設施(Load Sharing Facility,LSF)是由加拿大平台計算公司研制與開發的,由Toronto大學開發的Utopia系統發展而來。在使用范圍上,LSF不僅用於科學計算,也用於企業的事務處理。功能上,除了一般的作業管理特性外,它還在負載平衡、系統容錯、檢查點操作、進程遷移等方面作了很好的努力,並力圖使之實用化。
便攜式批處理系統(Portable Batch System,PBS)是一個資源管理和調度系統,它接受批處理作業(具有控制屬性的shell腳本),保留和保護作業直到它開始運行。因為一個批處理作業是一個無需用戶干預的,在計算機系統后台運行的程序,在批處理作業運行過程中,用戶無法實時地得到作業運行結果,所以PBS只能在作業執行后,將作業結果返回給提交者。目前,PBS包含開源免費的OpenPBS、商業付費的PBS Pro、Torque三種分支。
二、SGE 常見指令
- qsub 提交任務
-cwd | #從當前工作路徑運行作業 |
-wd working_dir | #定義工作目錄 |
-o path | 定義標准輸出文件路徑、文件名 |
-e path | #定義標准錯誤輸出文件路徑、文件名 |
-j y[es]|n[o] | #定義作業的標准錯誤輸出是否寫入到輸出文件中 |
-now y[es]|n[o] | #立即執行作業 |
-a date_time | #作業開始運行時間 |
-b y[es]|n[o] | #指定運行程序是二進制文件還是腳本文件,默認n |
-m b|e|a|s|n | #定義郵件發送規則。 |
b:作業開始時發送。e:作業結束時發送。a:作業失敗時發送 s:作業掛起時發送。n:不發送 | |
-M user[@host] | #定義郵件地址 |
-l resource=value | #表明作業運行所需要的資源。【-l arch=solaris64,h_vmem=750M,permas=1】 |
-N job_name | #重命名作業名 |
-q queue_name | #定義作業運行隊列 |
-S shell_path | #指定運行Shell環境 |
-P project_name | #定義項目名稱,前提是存在該項目 |
-p priority | #定義優先級,-1023 到 1024 , 默認值0 |
-r y[es]|n[o] | #定義作業失敗后是否重新運行 - |
v variable | #定義環境變量 |
-dl date_time | #定義作業到期時間,在作業到期時間之前,作業的優先級會逐步提高,直到管理員指定的最高級別。 |
舉個栗子:
qsub –cwd -l h=compute-1-1, h_vmem=5G,p=4 -q all.q work.sh
其中:
-cwd 在當前工作目錄;
-l 資源申請/限制,用逗號隔開
-q 申請隊列
關於資源限制域,可以通過如下指令查看:qconf -sc
下面列舉一些常見的關鍵字:
#name | shortcut | type | relop | default | urgency | define |
cpu | cpu | DOUBLE | >= | 0 | 0 | cpu nums |
h_vmem | h_vmem | MEMORY | <= | 0 | 0 | The per-job maximum memory limit in bytes. |
hostname | h | HOST | == | NONE | 0 | host name |
mem_free | mf | MEMORY | <= | 1g | 0 | MEM_NEEDED is the amount of memory (in megabytes M, or gigabytes G) that your job will require |
num_proc | p | INT | <= | 1 | 0 | process number |
qname | q | RESTRING | == | NONE | 0 | quene name |
s_data | s_data | MEMORY | <= | 0 | 0 | The per-process maximum memory limit in bytes. |
tmpdir | tmp | RESTRING | == | NONE | 0 | tmp dir |
virtual_free | vf | MEMORY | <= | 1g | 0 | The per-job maximum memory limit, dynamically |
- qstat 查看任務狀態
qstat -u username 查看某個用戶的任務
qstat -u \* 查看所有用戶的任務
qstat -j jobID 查看某個任務的詳細信息
qstat -f 查看用戶自己在每個節點的任務情況
qstat -q all.q -u \* 查看某個隊列下所有任務
qstat -q all.q@node1 -u \* 查看某個隊列的某一節點下所有任務
- qdel 刪除任務
qdel [ -f ] [ -help ] [-u wc_user_list] [ wc_job_range_list ] [ -t task_id_range ]
qdel job_id 刪除job
qdel -u usrname 刪除用戶的所有任務
- qhold 掛起任務
qhold job_id
qhold -u \* 掛起所有用戶的任務
- qalter更改任務屬性
qalter [ options ] wc_job_range_list [ -- [ command_args ]]
指令和qsub差不多,不多介紹了。