在運行如下程序時出現“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”報錯:
java -jar picard.jar SortVcf \ I=hg19.sites.vcf \ O=hg19.sites.sorted.vcf \ SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict
出現這種報錯說明內存不足。因此我們可以加上“-Xmx”參數
java -Xmx60g -jar picard.jar SortVcf \ I=hg19.sites.vcf \ O=hg19.sites.sorted.vcf \ SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict