http://blog.csdn.net/sdtsfhh/article/details/6726869
.Net Framework 1.1 是VS2003的，與2.0不太兼容，1.1開發的程序，在移植到2.0環境時，需要做的改動較大。
.net framework 2.0，3.0與3.5之間的關系：
.net framework 2.0 = CLR 2.0 + FCL(framework class library)
.net framework 3.0 = .net framework 2.0 + SP1 + WPF + WCF + WF + CardSpace
.net framework 3.5 = .net framework 3.0 + SP2 + new compiler
這三個版本framework的CLR都是2.0，因此，你會發現asp.NET的runtime還是只有1.1和2.0，像Linq這些新功能其實只是用新的編譯器加上一些新的類庫來實現的，3.5版本並沒有對CLR做大的升級。
VS2008支持在2.0，3.0和3.5三種版本下開發項目，VS2005的項目可以平穩的升到VS2008上，在VS2008下做VS2005的項目，用的編譯器和類庫同VS2005都是一樣的，但是提供了更好的開發環境。
3.5可以理解為2.0的插件或增強包，單獨安裝，在ASP.NEP環境中(IIS)，還是只能看到2.0，而看不到3.5。
另外，如果機器上安裝了VS2010，它支持.NET Framework 4.0。那么框架4.0對應的CLR版本是4.0。
http://blog.csdn.net/gykimo/article/details/26971515
CLR可以理解為JVM；
.Net Framework可以理解為類庫；
.Net和CLR的關系
.Net版本之間是有一定聯系的，目前為止微軟推出了3個版本的CLR，分別是 1.1， 2.0 ， 4.0 並且你要注意的是 .Net 4是基於CLR4的，而.Net 2.0 3.0 3.5都是基於 CLR2.0， 3.0 3.5其實只是在2.0的基礎上增加了新的功能，並沒有改變CLR。
所以，一旦有程序需要CLR2.0環境，你就需要安裝 2.0 3.0 或者 3.5。 建議是安裝3.5, 因為這樣就已經包含了2.0 3.0 的所有內容；而4.0是需要獨立安裝的。
CLR2.0 和 CLR4.0安裝順序沒有要求，所以你只需要一次性安裝一個 .Net 3.5 SP1 和 .Net 4.0 就可以了：