最近由於看基因組文章看的有點興奮，於是返了個場，學習下micRNA。
下載了一篇自己捯飭的paper，啃了很久還是不是很明白，然后我突然看了一個單詞，vivo，原來只以為vivo就是手機只能照亮你的美，到現在才發現vivo還能證明我的英語還真的很爛。
vivo：活潑的樣子
In vivo ：是活體,體內實驗
在學術文章中 in vivo 指的是活體中，不是某高贊助的廣告~~~
但是小編這里也暗暗自喜，想起了這個標題，micRNA對基因表達的調控，使得機體得以正常發揮作用，那豈止是照亮你的美~~。
一、摘要
總所周知，小ncRNA 可以對基因的表達產生一定的調控作用，並進一步的影響生物學功能。最近測序技術的發展和信息分析手段（生信人）的提升使得對ncRNA進行分類成為可能。從他們的前體結構和合成途徑以及作用方式上（precursor structures, biogenesis pathways and modes of action）可以分為
（1）small interfering RNAs（siRNA）：小干擾RNA， 是一個長20到25個核苷酸的雙股RNA，在生物學上有許多不同的用途。目前已知siRNA主要參與RNA干擾（RNAi）現象，以帶有專一性的方式調節基因的表達。
（2）microRNAs(miRNAs)：是一種小的，類似於siRNA的分子，由高等真核生物基因組編碼，miRNA通過和靶基因mRNA鹼基配對引導沉默復合體（RISC）降解mRNA或阻礙其翻譯。
（3）PIWI-interacting RNAs (piRNAs)：只在哺乳動物的睾丸中存在，並且只和PiWi蛋白結合形成piRNA復合物，和RNA沉默有關，作用於生殖細胞，調控轉座子表達。
（4）endogenous small interfering RNAs (endo-siRNAs or
esiRNAs)：內源性的小分子干擾RNA
（5）promoter associate RNAs (pRNAs)
（6） small nucleolar RNAs (snoRNAs) :核仁小分子RNA
（7）sno-derived RNAs
二、miRNA合成途徑
miRNA 廣泛的存在植物和動物組織內，公認在轉錄組水平上大約60%的基因被調控修飾過。其作用相當廣泛和重要，和眾多的生理學過程相關，比如分化、增殖、凋亡與發育。如果調控失敗，會導致各種疾病，比如肌肉萎縮、糖尿病和各種癌症。
miRNA的合成較為復雜，文章中描述較為枯燥，這里以動物中miRNA合成圖示為例.
三、細胞質miRNA的作用
miRNA對於靶基因的調控，如上圖，在植物和動物中不太一樣。在植物中通過（動物中較少）通過和靶基因的完美匹配來識別靶基因，並導致基因cleavage或者disruption。而在動物中，往往只有seed區域對於靶基因的識別有重要的作用，這一部分種子序列正好識別的是靶基因的3UTR區域。
然后，in vivo（體內實驗）中有些miRNA和靶基因互作也不是完全按照嚴格的配對原則（配對比例在~15%-80%）。
四、發揮作用的機制
For a long time, the predominant idea was that variation in the composition of RISCs led to alternative mechanisms for post-transcriptional control.
More recently, the outlook has changed. The current model proposes that, in a sequential process, the RISC switches off its targets by repressing mRNA translation at first and subsequently initiating degradation [27]. However, it has been suggested that the sequential order of these two events reflects kinetic differences between translational repression and mRNA decay rather than a cause-and-effect relationship between them。
很久以來，大家認為miRNA和靶基因結合之后就會導致mRNA直接降解，但是現在大家普遍認為在導致mRNA降解之前，還有對mRNA的抑制作用。
五、核內功能
核內小RNA的功能整理如下
-
調控RNA轉錄
-
調控mRNA
-
調控可變剪切
-
miRNA在轉錄中的作用
1、轉錄基因沉默
2、轉錄基因激活
六、結論
總而言之，無論是細胞核外，還是細胞核內的miRNA都是通過不同的機制來對基因表達進行調控的。其整體的調控示意圖如下
參考文獻:MicroRNA in Control of Gene Expression: An Overview of Nuclear Functions