就是指唯一比對的reads
現在人們已經開始避免使用unique mapped reads這個概念了，而轉向使用mapq值來保留高質量的比對結果。因為mapq值反應了一組比對結果發生的可能性，MapQ = -10 log10(P), 比如結果為10，那就是1/10的概率會出現這個比對結果，如果我們認為0.05%是一個小概率的話，那個mapq值為15就可以用於篩選了, 如果認為0.01%是個小概率的話，mapq值為20就可以用於篩選了。但是人們往往從30這個值開始試起（1/1000的概率），如果它的篩選結果符合你的測序要求，就可以使用它了。如果不行，可以適當的調整這個篩選值。
samtools view -bhS -q 30 input.sam > output.bam