Java讀取mat文件

概述

使用ujmp中的jmatio模塊讀取.mat文件到java程序中。

其實，ujmp主要是在模塊core中實現了矩陣運算，其余模塊都是復用了已有的開源庫。模塊jmatio是復用了已有的JMatIo，對這個讀取mat文件到java程序的庫做了一層封裝。從ujmp的官網(https://ujmp.org/)下載ujmp的jar包，但是這一個jar包並不能讀取mat文件(雖然jar包內有jmatio模塊)，還需要下載一個JMatIo的jar包(http://pan.baidu.com/s/1nuMMqvB)。將兩個jar包都加入到工程中才可以從mat文件中順利讀取數據到java程序中。

添加jar包到工程

在創建的工程中新建一個lib文件夾，將以上兩個jar包拷貝到此文件夾中，必須要拷貝到項目中。比如，我之前是將兩個jar包放在桌面上，但是當把jar包刪除或移動之后，程序就不能運行了，很簡單的道理。

接下來就是將兩個jar包添加到工程中，以便在程序中使用這兩個包中定義的類。

讀取mat文件的代碼

/**
 * Created by hfz on 2015/12/22.
 */
import org.ujmp.jmatio.ImportMatrixMAT;
import org.ujmp.core.Matrix;
import java.io.File;
import java.io.IOException;
public class test{
    public  static void main(String[] args)throws IOException{
        //相對路徑的根目錄是當前工程的目錄（C:\Users\hfz\Desktop\test）。另外相對路徑的起始處無“/”
        ImportMatrixMAT test=new ImportMatrixMAT();
        File file=new File("data/A.mat");
        Matrix testMatrix=test.fromFile(file);
        testMatrix.showGUI();
        System.out.println("ss");
    }


}

另外一種更簡單的方式

更簡單的方式就是直接使用jmatio庫從.mat文件讀取數據到內存中，並將其轉化為二維數組的形式，代碼如下： 

import com.jmatio.io.MatFileReader;
import com.jmatio.types.MLArray;
import com.jmatio.types.MLDouble;
 MatFileReader read = new MatFileReader("data/totalDataSet.mat");
MLArray mlArray=read.getMLArray("img");//mat存儲的就是img矩陣變量的內容
MLDouble d=(MLDouble)mlArray;
double[][] matrix=(d.getArray());//只有jmatio v0.2版本中才有d.getArray方法

jmatio參考文檔：http://www.mathworks.com/matlabcentral/mlc-downloads/downloads/submissions/10759/versions/1/previews/doc/overview-summary.html

jmatio下載：http://pan.baidu.com/s/1nuMMqvB

參考：

http://www.programcreek.com/java-api-examples/index.php?api=com.jmatio.io.MatFileReader

https://www.kaggle.com/c/decoding-the-human-brain/forums/t/7862/using-jmatio/65560

http://blog.madhukaraphatak.com/matfile-to-rdd/