如題，作為一名學術研究者，關於simulation和emulation是有必要分清楚的。
先給出一些網上的參考定義：
解釋一： 模擬（Simulation）即選取一個物理的或抽象的系統的某些行為特征，用另一系統來表示它們的過程。模擬技術的高級階段稱為仿真模擬（Emulation）、系統仿真，即用一數據處理系統來全部或部分地模擬某一數據處理系統，以致於模仿的系統能想被模仿的系統一樣接受同樣的數據、執行同樣的程序、獲得同樣的結果。
解釋二： 模擬(Emulation)是試圖模仿一個設備的內部設計；仿真(Simulation)是試圖模仿一個設備的功能。
解釋三： Emulation：When one system performs in exactly the same way as another, though perhaps not at the same speed. A typical example would be emulation of one computer by ( a program running on) another. You migh use emulation as a replacement for a system whereas you would use a simulation if you just wanted to analyse it and make predictions about it. Simulation： Attempting to predict aspects of the behaviour of some system by creating an approximate (mathematical) model of it. This can be done by physical modelling, by writing a special-purpose computer program or using a more general simulation package, probably still aimed at a particular kind of simulation (e.g. structural engineering, fluid flow). Typical examples are aricraft flight simulators or electronic circuit simulators. A great many simulation languages exist, e.g. {Simula}
simulation是模擬，emulation是仿真。顧名思義，模擬看中是的是輸入與輸出是否滿足要求，並不在乎中間的實現過程。而仿真則更像白盒，它要求必須設計出和系統一致的邏輯過程。
參照這個定義，說的更加直白些，那就是simulation模擬系統的行為功能，emulation模擬系統的運作過程，行為功能的實現可以自定義，但是系統的運作必須符合已知的邏輯。
如果需要給定相互關系的話，那么emulation就包含simulation。講simulation想像成一個一個的功能塊，然后將這些功能塊使用邏輯鏈接起來，形成一套完整的方案，就是emulation。
以前的時候經常使用simulation，還不知道有emulation的存在，實在是孤陋寡聞了。不過貌似以前寫的文章也都是涉及一些算法，將其封裝成功能塊執行的，也不涉及一整套大系統的開發。
現在要做的大型仿真，如果自己編寫或者使用一些現有的仿真工具如NS3之類的，整體上應該就算是Emulation了。但是針對自己涉及的那一塊，可能也就以一個模塊的形式添加到現有的軟件系統中，那么這部分應該就算是Simulation了。
以上僅為個人理解。