注：本文是作者上學期間科研工作需要所總結，原文發表在QQ個人空間，因工作若干年后還有同學需要做類似工作，公開至此處，便於更多人檢索到。
作者：Sinsonglew 出處：http://www.cnblogs.com/sinsonglew 歡迎轉載，也請保留這段聲明。thanks :)
1 MRT工具的安裝
檢查自己的電腦上是否已安裝java.exe（搜索java.exe即可，當然也可不檢查，重新安裝一份），在WINDOWS平台下，JAVA.虛擬機的安裝路徑及MRT的安裝路徑不宜包含空格。
在WINDOWS平台下的安裝過程中，輸入路徑名注意斜杠“\”應改為“/”，比如 c:\Modis must be entered as c:/Modis.
安裝MRT之前需要先安裝JAVA虛擬機，因為安裝MRT的過程中會提示輸入java.exe的路徑。
2 MRT工具的使用及批處理操作
2.1 界面操作
安裝完畢之后，打開MRT的安裝路徑文件夾，打開bin文件夾，找到ModisTool.bat，創建該文件的快捷方式到桌面，雙擊快捷方式便進入MRT的GUI界面（見Fig.1）。
Fig.1中，對MODIS MYD13Q1數據，選擇輸出EVI 、NDVI兩個數據，指定輸出路徑輸出文件格式為GEOTIFF，采樣方式為最近鄰，投影類型為UTM，輸出像元大小為250m，然后直接點擊run就可以了。
Fig.1 MRT GUI界面
2.2 批處理投影
見Fig.1中紅色橢圓圈定部分，設定一個HDF文件投影變換的參數后，點擊“Save Parameter File…”保存自己設定的參數文件，假設為head.prm。
新建一個記事本文件，將下面的內容粘貼進去，需更改幾處。更改完畢之后，將記事本文件另存為“.bat”文件，假設為“modis.bat”。
rem Set the MRTDATADIR environmental var to the MRT data directory. rem ********************************************************** rem rem replace "c:\Modis\data" to your own MRTDATADIR setuped" rem please refer to "ModisTool.bat",right key and choose "Edit" and you'll get "MRTDATADIR" rem *********************************************************** set MRTDATADIR=c:\Modis\data rem ********************************************************** rem rem change head.prm to your own .prm file, then it's ok! rem if somethings wrong, change resample to full path. i.e. rem " for %%i in (*.hdf) do resample -p head.prm -i %%i -o %%iout.tif " rem to "for %%i in (*.hdf) do C:\Modis\bin\resample.exe -p head.prm -i %%i -o %%iout.tif" rem rem *********************************************************** for %%i in (*.hdf) do resample -p head.prm -i %%i -o %%iout.tif
以上內容可粘貼到自己的記事本文件中，注意紅色字體部分為需要改動部分。藍色字體部分為注意內容。REM為注釋的意思，其后所注內容可刪去。
新建一個文件夾，假設起名為DATA,，將head.prm，modis.bat, 所有MODIS HDF數據放在該文件夾下，雙擊modis.bat，便可看到命令窗口的批出理過程，如發生異常，參見該節中藍色內容。
2.3 批處理拼接
備注：該操作數據及BAT文件須放在一個文件夾（文件夾起名請用英文，MRT對中文路徑數據會打不開）下。
操作步驟:
1:新建一個DATA文件夾，將HDF數據拷到DATA文件夾下;
2:在DATA文件夾下再新建個Result文件夾（存放拼接后數據）;
3:將以下代碼內容粘到一個TXT文件中（下文代碼綠色字體內容為代碼注釋內容，請刪去），更改TXT文件擴展名為BAT即可，假設你命名該BAT文件名為MOSAIC.BAT；
4：點擊MOSAIC.BAT，即可進行拼接操作，如有問題，請參見"2.2 批處理投影"中提示的注意內容。
PS: 以下代碼未考慮中間天數間斷的情況，比如對MODIS時間分辨率為16天的數據，在一個應連續的等差數列中間有數據缺失，存在相差32天的情況，可能會報錯，請注意。
set MRTDATADIR=c:\Modis\data set /a DAY=2009257 rem ***開始日期*** set /a DEADLINE=2009273 rem ***結束日期*** :start if %DAY% leq %DEADLINE% (goto ORDER) else exit :ORDER rem **將當天的圖幅數據文件名放在一個TXT文件中** dir *%DAY%.*.hdf/a/b/s > MOSAICINPUT.TXT rem **拼接HDF12種數據中的第一種** c:/Modis/bin/mrtmosaic.exe -i MOSAICINPUT.TXT -s "1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0" -o MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf rem **將拼接后數據復制到已建Result 文件夾中並刪除當天的數據** copy MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf Result & del MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf del *%DAY%.*.hdf set /a DAY= %DAY% + 16 rem ***拼接下一個時相的數據*** goto start