安裝cygwin：
由於NDK編譯代碼時必須要用到make和gcc，所以你必須先搭建一個linux環境， cygwin是一個在windows平台上運行的unix模擬環境,它對於學習unix/linux操作環境，或者從unix到windows的應用程序移植，非常有用。通過它，你就可以在不安裝linux的情況下使用NDK來編譯C、C++代碼了。下面我們一步一步的安裝cygwin吧。
首先要下載cygwin的安裝程序setup.exe，下載地址為：
下載完成后雙擊運行setup.exe，可以看到向導界面如下：
點擊下一步，此時讓你選擇安裝方式：
1）Install from Internet：直接從Internet上下載並立即安裝（安裝完成后，下載好的安裝文件並不會被刪除，而是仍然被保留，以便下次再安裝）。
2）Download Without Installing：只是將安裝文件下載到本地，但暫時不安裝。
3）Install from Local Directory：不下載安裝文件，直接從本地某個含有安裝文件的目錄進行安裝。
下面測試一下cygwin是不是已經安裝好了：
運行cygwin，在彈出的命令行窗口輸入：cygcheck -c cygwin命令，會打印出當前cygwin的版本和運行狀態，如果status是ok的話，則cygwin運行正常。然后依次輸入gcc –version，g++ --version，make –version，gdb –version進行測試，如果都打印出版本信息和一些描述信息，非常高興的告訴你，你的cygwin安裝完成了！
下載Android NDK：
下載站點：
http://dl.google.com/android/ndk/android-ndk-r4-windows.zip
http://androidappdocs.appspot.com/sdk/ndk/index.html
http://developer.android.com/sdk/ndk/overview.html
如果上面的站點下載不了，也可以到網上找一些下載站點，下載r4版本的android_ndk，下載后直接解壓即可。可以考慮和android SDK放在相同的目錄下，對以后的開發可能會帶來一些便利。
配置NDK環境變量
首先找到cygwin的安裝目錄，找到一個home/<你的用戶名>/.bash_profile文件，我的是C:/cygwin/home/Administrator/.bash_profile，（如果找不到，那就到網上去找解決辦法把，這種情況確實可能發生）打開bash_profile文件，添加如下內容(根據你的ndk的安裝目錄，我的是D盤android-ndk-r4)：
ANDROID_NDK_ROOT=/cygdrive/d/android-ndk-r4
export ANDROID_NDK_ROOT
ANDROID_NDK_ROOT這個名字是隨便取的，為了方面以后使用方便，選個簡短的名字，然后保存。打開cygwin，輸入cd $ANDROID_NDK_ROOT，如果輸出上面配置的/cygdrive/d/android-ndk-r4信息，則表明環境變量設置成功了。
安裝eclipse組件：
Android SDK 和 ADT就不介紹了，下面介紹一個新的組件——CDT。CDT是eclipse開發c++的組件包，這里聲明一下，使用NDK開發android是不需要CDT的。如果你安裝了CDT，會在以后review別人的c++ code時帶來一些方便。可以到CSDN上下載CDT的壓縮包，加壓后把對應的目錄下的文件拷貝到eclipse的對應目錄下就可以了。
部署並運行第一個hello-jni例子
用NDK來編譯程序：
現在我們用安裝好的NDK來編譯一個簡單的程序吧，我們選擇ndk自帶的例子hello-jni，我的位於D:/android-ndk-r4/samples/hello-jni(根據你具體的安裝位置而定)，運行cygwin，輸入命令cd /cygdrive/d/android-ndk-r4/samples/hello-jni，進入到D:/android-ndk-r4/samples/hello-jni目錄。輸入$ANDROID_NDK_ROOT/ndk-build，執行成功后，它會自動生成一個libs目錄，把編譯生成的.so文件放在里面。($ANDROID_NDK_ROOT是調用我們之前配置好的環境變量，ndk-build是調用ndk的編譯程序)，此時去hello-jni的libs目錄下看有沒有生成的.so文件，如果有，你的ndk就運行正常啦！
在eclipse中配置參數編譯源碼生成.so文件
1）導入hello-jni工程
2）這時你的工程可能會報錯，沒關系，工程右鍵選擇Build path->config Build path，如下圖：
然后選擇builders->new，如下圖：
選擇program，配置如下圖：
出現了添加界面，首先給編譯配置起個名字，如：C_Builder或者是默認的New_Builder，如上圖，
設置Location為<你cygwin安裝路徑>/bin/bash.exe程序，例如：C:/cygwin/bin/bash.exe；
設置Working Directory為<你cygwin安裝路徑>/bin目錄，例如：C:/cygwin/bin
設置Arguments為：
--login -c "cd /cygdrive/d/android-ndk-r4/samples/hello-jni && $ANDROID_NDK_ROOT/ndk-build"
上面的配置中/cygdrive/e/android-ndk-r5/samples/hello-jni是你當前要編譯的程序的目錄，$ANDROID_NDK_ROOT是之前配置的ndk的環境變量，這兩個根據你具體的安裝目錄進行配置，其他的不用變，Arguments這串參數實際是給bash.exe命令行程序傳參數，進入要編譯的程序目錄，然后運行ndk-build編譯程序。
接着配置refresh選項：
勾選Refresh resources upon completion
再配置Build Options選項，如下圖：
勾選上最后三項，之后點擊Specify Resources按鈕，選擇資源目錄，勾選你的項目目錄即可：
最后點擊Finish，點擊OK一路把剛才的配置都保存下來，注意：如果你配置的編譯器在其它編譯器下邊，記得一定要點Up按鈕，把它排到第一位，否則C代碼的編譯晚於Java代碼的編譯，會造成你的C代碼要編譯兩次才能看到最新的修改，如下圖，一定要保證New_Builder在第一位：
現在來測試一下是否可以自動編譯呢，打開項目jni目錄里的hello-jni.c文件把提示Hello from JNI!改成其他的文字：如："Hello，My name is lusifer."，然后再模擬器中運行你的程序，如果模擬器中顯示了你最新修改的文字，那么你已經全部配置成功啦！
轉自：http://ygc87.blog.163.com/blog/static/2396065201221063030169/