幾種常見ECG數據格式及對比


SCPDICOMHL7aECGGDF格式及對比

    本文檔首先給出SCP、DICOM、HL7aECG、GDF四種心電信號格式的具體數據結構,然后分析其各自的特點及適用范圍。

一、SCP-ECG format

    這種格式是專門針對ECG數據的標准格式,其中包含了ECG數據波形,患者信息,

ECG采集信息以及測量診斷信息等豐富內容。

    SCP-ECG格式主要分為Title(2 bytes for CRC-checksum and 4 bytes for size of ECG record)和Section0-Section11兩部分。其中Title,Section0,Section1是必須有的,其他部分則是可選的。

具體數據結構如下:

Table 1. Structure of  SCP-ECG records.

Mandatory  

   2 bytes - checksum - crc   -CCITT over the

                   entire record

          (excluding this   word)

Mandatory  

   4 bytes - (unsigned) size   of the entire ecg

                   record (in bytes)

Mandatory  

                   (Section   0)

pointers   to data-areas in the record

Mandatory

                   (Section   1)

   header  information - patient data/ecg acquisition   data

Optional  

                   (Section   2)

   huffman tables used in   encoding of ecg data (if used)

Optional

                   (Section   3)

                  ecg  lead definition

Optional  

                   (Section   4)

         QRS locations (if reference beats are encoded)

Optional        

                   (Section   5)

        encoded reference beat data if reference beats are stored

Optional        

                   (Section   6)

        "residual signal" after reference beat subtraction if   reference         beats are stored,   otherwise encoded rhythm data

Optional

                       (Section 7)

                  global  measurements

Optional  

                   (Section   8)

   textual diagnosis   from  the "interpretive"   device

Optional

                   (Section   9)

        manufacturer specific diagnostic and over-reading data

        from  the "interpretive"   device

Optional  

                  (Section   10)

               lead  measurement  results

Optional        

                      (Section 11)

 universal statement codes   resulting from  the interpretation

 

缺點:

(1)只支持靜態心電信息,不支持信號平均心電即晚電位信息,不支持動態心電信息(HOLTER)和運動心電信息(Exer- cise ECG)等;

(2)僅僅支持RS232串口傳輸,使用二進制方式存儲不利於網絡傳輸的信息交換;

(3)使用的復雜壓縮算法難以進行實現和測試,也不能支持預約等其他工作流。

優點:

(1)是最早開始研究的心電數據統一存儲標准,它所包含的心電方面的信息最為全面,能夠滿足常規全部心電檢查的要求;

(2)所需要的存儲空間也是最小的。

 

二、DICOM format

     是一種醫學圖像格式,其文件格式的關系如下:

 

               

                         Figure 2-1  File-set and File Format

 

 

 

              Figure 2-2 DICOM data set and data element structures

 

      由以上兩個圖可知,DICOM File-set 里面可以包含多個DICOM File,每個DICOM File中包括DICOM File Meta Information和DICOM Data Set(其中DICOM SOP Instance就是在DICOM Data Set當中)兩個部分,Data Set 中又包含多個Data Elemet,每個Data Element中的值是根據VR的類型來決定編碼的格式的(關於VR(Value Representation)的詳細信息在DICOM手冊的PS3.6中Page8-139中有具體說明),Data Element里面還可以有多個Item(具體的Data Elemet編碼的例子可在DICOM手冊說明的PS3.5的Page43-44中找到)。

      因此,DICOM格式是采用信息對象模型的方式來描述現實世界的對象信息的,每一個信息實體都與現實世界某個特定對象相關聯,對於編碼的數據結構只是給出一個模型,具體的編碼方法要根據信息的類型來決定。

      優點:

(1)不僅制定了波形格式和檢查報告格式,也指定了設備之間如何通訊;

(2)還能支持重要的工作流事件(如撤銷、預約請求等)。

      缺點:

      適用於已有PACS系統部署的醫院信息化系統;但能夠管理DICOM新店數據的PACS廠家很少,這導致心電數據管理與現有PACS系統的全面融合還需要一段時間。

 

三、HL7aECG format

      HL7aECG格式,又叫做FDAXML格式,是HL7心電圖注釋標准,采用XML的數據存儲格式,專注於繪圖、標注、注釋數據。

       其數據格式的實體及相互關系的圖表如下:

 

 

                      Figure 3-1 The Entity-Relationship Model

     關於數據格式設計中每個域的詳細定義,可參考格式文檔FDA-EGC-XMLDataFormat  at page 18-27,Appendix E。

FDAXML標准創建了用於存儲ECG數據的XML標記原理,並詳細說明了這些標記的意義。通過XML scheme文件來規定數據文件中元素的組織結構,並介紹各元素代表的內容。

      優點:

(1)圖表支持可支持實時、存錄的記錄方式;

(2)最大的特點就是能夠精確繪圖注釋;

(3)尤其適用於臨床葯物試驗;

(4)這種數據結構能夠方便地進行網絡傳輸。

     缺點:

(1)它丟失了心電圖需要的某些重要字段,例如參考醫生以及部門信息等;

(2)HL7信息模型目前也沒有廣泛用來和圖像采集模塊通訊。

 

四、GDF format

      GDF是Biosig的一種通用數據格式,可使用SigViewer打開。這種格式的最大特點就是它包含很多EVENT,可以同時存儲EEG、ECG、sleep-relative等方面的數據,而不僅僅是心電數據的格式文件。

(一)GDF文件的大體結構

Table 4-1: Structure of a GDF file. NS, NT, and NEV indicate the number of channels, number of TLV elements, and the number of events, respectively,

 

Description

size [bytes]

 

1

Fixed   header, (header1)

256

1

2

Variable header,channel-specific

information (header 2)

256*NS

1

3

Optional header, tag-length-value

structure, (header 3)

>=4*NT + length of each value field

<=Length of header–256*(NS+1)

0<= NT <256

 

4

Data   section

number_of_records times bytes   per record

<=1

 

5

Event   table

8 + NEV*6 {mode 1} or

8 + NEV*12 {mode 3}

<=1

 

 

   

(二)GDF文件數據結構中各個域所包含的信息

(1)Fixed header, (header1):

         Version identification

         Patient identification

          Patient message(including disease,states,etc)

         Recording message

         Time(start,duration,etc)

         Header length/size

         Patient classification

         Equipment ID

         Electrode position message

         NS: number of signals(channels)

 

(2)Variable header, (header 2):

         Label

         Type of transducer/sensor

         Physical dimension message

         Digital dimension message

         Time offset(relative sampling time delay between channels)

         Pre-filter information

         Samples per record

         Type of data

         Sensor specific information

 

(3)Optional header, (header 3)

         Tag

         Length

         Value

 

(4)Data section

         nr samples from each channel

         (nr:number of record)

 

(5)Event table

         Mode

         NEV

         Sample-rate associated with event position

 

※ Mode info :{Type, POS} or {Type, POS, DUR, CHAN}

 

四種格式對比總結:

(1)SCP-ECG標准是目前為止可選的最全面的心電信息標准化通訊協議,但只支持靜態心電信息,不支持動態、運動心電信息;

(2)DICOM格式憑借其開放互聯的架構和面向對象的方法,更注重醫學影像信息的交換、傳遞;

(3)FDAXML格式能夠精確地進行繪圖和注釋,可描述實時心電信息,適用於臨床葯物試驗;

(4)GDF格式功能強大,能包含除ECG以外多種生物醫學信息,如EEG,sleep-related EVENTS等。

 

 

 

 


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