前提：保證NDK環境建立ok,可參考文章“Windwos下Android NDK開發環境搭建“
若想在設備上使用，必須取得root權限才可。
注意在/home/用戶/.bash_profile中環境變量的配置：
以上配置是為保證編譯，調試過程能正確使用相關命令。
接下來以調試android ndk下samples中的hello-jni為例，來闡述調試過程。
由於：
The new NDK has a Windows version of ndk-build, but ndk-gdb is still a
bash script. This doesn't only mean that you need Cygwin to run it, it
also means that everything written in ndk-gdb is written from a Linux
standpoint.
所以，在windows下要用ndk-gdb的話，我們必須安裝Cygwin.
如果在Windwos下運行ndk-gdb的話，將會出現如下問題。
值得注意的是，我們還必須在Cygwin中，配置ANDROID_NDK_ROOT這個環境變量，配置方法參見”Windwos下Android NDK開發環境搭建“中所描述。
否則在使用ndk-build會出現如下問題：
awk fatal:Can't open source file ‘/cygdrive/d/android-ndk-r5c/samples/hello-jni/ D:\android-ndk-r5c/build/awk/check-awk.awk' for reading (no such file or directory)
Error:Could not run 'awk' command.Do you have it install properly?
解決方法來自：https://groups.google.com/forum/#!msg/android-ndk/_4JNdY_h558/vdzP-4CkQrUJ
接下來，將按照如下步驟來調試。
1、啟動Cygwin Terminal.
2、進入hello-jni的Android工程目錄
$ cd $ANDROID_NDK_ROOT/samples/hello-jni
3、以調試模式構建c/c++程序，目的是生成共享庫，.so文件
$ ndk-build NDK_DEBUG=1
這里我們使用 ndk-build NDK_DEBUG=1 生成帶符號表的 .so
或者修改AndroidManifest.xml,設置android:debuggable=true。
注意：從上面執行的結果可看到，除了得到編譯的動態共享庫，還有Gdbserver和Gdbsetup。如果不是設置為調試模式不會產生這兩個文件。
4、生成build.xml文件(用於用ant打包生成apk,見下面的步驟5)
$ android update project -p . -t android-18 (在cygwin下，$ android.bat update project -p . -t android-18)
5、$ ant debug install
注1：如果在構建過程中出現如下錯誤：
[aapt] invalid resource directory name: C:\Users\Paul\git\XXXXXXXX\bin\res/crunch
在網上找到如下的解決方法：
本人是通過執行“ant clean debug install”來解決以上錯誤的。
注2：如果沒構建的工程，涉及到庫工程。則在構建過程中可能會出現類似如下錯誤：
則需在庫工程目錄下，為庫工程執行“ android.bat update project -p . -t android-18”來生成需要的build.xml文件。
6、啟動應用程序的ndk-gdb調試。
如果你要調試的程序沒有運行，需使用ndk-gdb --start。
如果你要調試的程序已經在運行了，直接運行ndk-gdb。
$ ndk-gdb --start
這時會啟動應用，接着就可以使用gdb的命令了。
7、用list或l命令查看C文件的內容.
(gdb) list
可以用list 1,100 或 l 1,100來指定顯示源文件的范圍。
如果遇到No symbol table is loaded. Use the "file" command.則需使用以下命令加載需要調試的so文件：
8、用break 或 b命令設定斷點
(gdb) break 30 //將斷點設置在30行
9、查看斷點信息
(gdb) info breakpoints
10、使用c或者continue命令繼續運行程序。
(gdb) continue
11、 按返回鍵再手動重啟應用（觸發程序運行在斷點處），就會停在30行斷點處了。（注意：如果停止了應用程序是不行的）
12、為了使程序繼續運行下去，執行continue命令。
注：在調試其他native程序時，如果在第10步出現錯誤：
Continuing.
錯誤原因：使用ndk-gdb --start 啟動程序第一個activity，但是此時so文件並沒有被加載。
解決方法：首先打開程序並使用，在保證so文件已經被使用的情況下，調用ndk-gdb命令調試程序進程。