一般我們開發windows下的程序都是使用VC，VS這樣的可視集成化的IDE，但是有很多開源軟件例如mplayer，vlc等為了保持程序的跨平台性，通常都會選擇使用GUN標准進行開發，linux環境下GUU編譯工具一般都是gcc，g++等。而到了windows平台上，我們也可以選擇Cygwin或者Msys+MingW等編譯器進行開發。下面是特酷吧在學習中整理的資料。
Cygwin
Cygwin是一些自由軟件的集合，所謂的Cygwin的官方解釋是：GUN + Cygnus + windows = cygwin。Cygnus最初的時候是把gcc，gdb等這些linux平台下的編譯調試等工具進行改造，使他們能夠配合生成win32格式的目標文件。為了節省開發工作，他們編寫了一個共享庫cygwin.dll,這個庫里集成了win32.api中沒有的unix風格的調用，也就是編寫了一個unix系統的模擬層。Cygwin包含了一套庫，該庫允許在win32環境中實現POSIX系統調用的API並有一套GUN開發工具集。它由兩部分組成。一個是核心的cygwin1.dll，這個dll以windows的api實現了Linux下的大部分API。另一個部分則是newlib，實際上就是glibc，它將調用cygwin1.dll中的實現，然后以glibc的形式呈現給用戶使用。它但一個很大的缺點是Cygwin不支持Unicode。Cygwin的安裝非常簡單，到http://www.cygwin.com/下載安裝文件，直接在windows下安裝即可。配置好環境之后，就可以和linux一樣在終端界面使用Cygwin了。
MingW+Msys
該組合在網絡上評價很高，特酷吧查詢到的結果是，很多人都認為Msys+MingW比Cygwin小巧且效率高。特酷吧認為Msys+MingW是早些年的說法，現在只要安裝MingW，再安裝軟件的時候就會讓你選擇是否需要安裝Msys，如果選中的話，則Msys會繼承到MingW中，安裝完成以后在mingW shell中就可以編譯程序，類似liunx的終端。
Msys的全稱是“Minimal GNU（POSIX）system on Windows”，是一個小型的GNU環境，包括基本的bash，make等等。是Windows下最優秀的GNU環境,特酷吧認為他就是模擬linux系統的一個集成環境包，當然不具備編譯功能，編譯功能由MingW實現。
MingW，即 Minimalist GNU For Windows。它是一些頭文件和庫的集合，該集合允許人們在沒有第三方動態鏈接庫的情況下使用GCC產生 Windows32程序。開發MinGW是為了那些不喜歡工作在 Linux(FreeBSD) 操作系統而留在 Windows 的人提供一套符合GNU的GNU工作環境（據說Cygwin是有版權的）。
Msys+MingGW他們結合就組成了一個在windows下的類似linux系統的終端環境，在該環境下可以使用一些linux命令，還可以編譯程序。
MingW的安裝配置
到http://sourceforge.net/projects/mingw/files/latest/download下載類似mingw-get-inst-20120426的文件，點擊安裝則會選擇要安裝的編譯器以及Msys系統數據庫（已經集成了MingW），一般做c/c++開發需要選中C Compiler、C++ Compiler、MSYS Basic System ，選上之后，安裝程序會他通過網絡安裝好所有需要的文件，很方便。
安裝完成之后，最好設置一下環境變量：
我的電腦屬性，選擇“高級”選項卡。點擊“環境變量”按鈕。
點擊“新建(W)”，新建環境變量：MINGW_HOME，變量值為你剛才安裝MinGW的安裝目錄。
選擇環境變量Path，點擊“編輯"。在尾部加入“;%MINGW_HOME%\bin”。
完成之后再cmd下輸入gcc -v和g++ -v如果出現mingw的版本信息則說明安裝成功，以后我們就可以使用mingW shell進行類似linux下的編譯操作。
對於這兩個軟件特酷吧常用的就是MingW。
MingW和Cygwin的區別：
可以參考：http://hi.baidu.com/ooxxer/item/d25dccc072846a50ac00ef7e 特酷吧在此引用如下：
(1)首先明確的是MingW和cygwin都可以用來跨平台開發。
MinGW是Minimalistic GNU for Windows的縮寫，也就是Win版的GCC[只是一個編譯工具，Msys是對MinGW的輔助]。
Cygwin則是全面模擬了Linux的接口，提供給運行在它上面的的程序使用，並提供了大量現成的軟件，更像是一個平台。
相對的MingW也有一個叫MSys（Minimal SYStem）的子項目，主要是提供了一個模擬Linux的Shell和一些基本的Linux工具。因為編譯一個大型程序，光靠一個GCC是不夠的，還需要有Autoconf等工具來配置項目，所以一般在Windows下編譯ffmpeg等Linux下的大型項目都是通過Msys來完成的，當然Msys只是一個輔助環境，根本的工作還是MingW來做的。
(2)用MingW和cygwin編譯出來的程序的區別
首先MingW和cygwin都不能讓Linux下的程序直接運行在Windows上，必需通過源代碼重新編譯。
現代操作系統包括Windows和Linux的基本設計概念像進程線程地址空間虛擬內存這些都是大同小異的，之所以二者上的程序不能兼容，主要是它們對這些功能具體實現上的差異，首先是可執行文件的格式，Window使用PE的格式，並且要求以.EXE為后綴名。Linux則使用Elf。其次操作系統的API也不一樣，如Windows用CreateProcess()創建進程，而Linux使用fork()。 所以要移植程序必然要在這些地方進行改變，MingW有專門的W32api頭文件，來把代碼中Linux方式的系統調用替換為對應的Windows方式。而Cygwin則通過cygwin1.dll這個文件來實現這種API的轉換，並模擬一個Linux系統調用接口給程序，程序依然以Linux的方式調用系統API，只不過這個API在cygwin1.dll上，cygwin1.dll再調用Windows對應的實現，來把結果返回給程序。 可以用查看他們編譯好的程序的導入表來驗證這點。
二者生成的程序都是能在Windows上運行的EXE文件，顯然都是PE格式，用一個PE格式查看工具檢查一下就能發現，Cygwin生成的程序依然有fork()這樣的Linux系統調用，但目標庫是cygwin1。而MingW生成的程序，則全部使用從KERNEL32導出的標准Windows系統API。
這樣看來用Mingw編譯的程序性能會高一點，而且也不用帶着那個接近兩兆的cygwin1.dll文件。 但Cygwin對Linux的模擬比較完整，甚至有一個Cygwin X的項目，可以直接用Cygwin跑X。
另外Cygwin可以設置-mno-cygwin的flag，來使用Mingw編譯。 而與Cygwin更有可比性的MSys上的工具也是通過Cygwin這種模擬的方式來提供的。
總之這兩個項目有千絲萬縷的關系，一個不恰當的比方，如果Mingw是MFC，Cygwin就是.NET了。
簡單的說來：
1.修改編譯器,讓window下的編譯器把諸如fork的調用翻譯成等價的形式--這就是mingw的做法.
2.修改庫,讓window提供一個類似unix提供的庫,他們對程序的接口如同unix一樣,而這些庫,當然是由win32的API實現的--這就是cygwin的做法