MySQL 5.6正式版發布了，相對於5.5版本作出了不少改進，其源碼安裝配置方式也有所變化，本文根據實際操作，不斷嘗試，精確還原了安裝的具體步驟。
環境：CentOS 6.3/6.4 最小化缺省安裝，配置好網卡。
安裝MySQL前，確認Internet連接正常，以便下載安裝文件。
先使用 yum -y update 指令升級系統到最新版本。
本安裝將MySQL的數據文件與執行文件分離，如果你打算設置到不同的路徑，注意修改對應的執行命令和數據庫初始化腳本。
＃ 修改防火牆設置，打開3306端口
vi /etc/sysconfig/iptables
-A INPUT -m state --state NEW -m tcp -p tcp --dport 3306 -j ACCEPT
＃ 重啟防火牆使新設置生效
service iptables restart
＃ 新增用戶組
groupadd mysql
＃ 新增用戶
useradd mysql -g mysql
＃ 新建數據庫執行文件目錄
mkdir -p /usr/local/mysql
＃ 新建數據庫數據文件目錄
mkdir -p /db/mysql/data
＃ 編輯PATH搜索路徑
vi /etc/profile
Append these 2 lines to the end of the file:
PATH=/usr/local/mysql/bin:/usr/local/mysql/lib:$PATH
export PATH
＃ 生效PATH搜索路徑
source /etc/profile
＃ 編輯hosts文件，加入本機IP和主機名
vi /etc/hosts
192.168.211.100 centhost.centdomain
＃ 安裝編譯源碼所需的工具和庫
yum -y install wget gcc-c++ ncurses-devel cmake make perl
＃ 進入源碼壓縮包下載目錄
cd /usr/local/src
＃ 下載源碼壓縮包，下載包34M大小，有點慢，等吧。
wget http://dev.mysql.com/get/Downloads/MySQL-5.6/mysql-5.6.10.tar.gz/from/http://cdn.mysql.com/
＃ 解壓縮源碼包
tar -zxvf mysql-5.6.10.tar.gz
＃ 進入解壓縮源碼目錄
cd mysql-5.6.10
＃ 從mysql5.5起，mysql源碼安裝開始使用cmake了，執行源碼編譯配置腳本。
cmake \
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/mysql \
-DMYSQL_UNIX_ADDR=/usr/local/mysql/mysql.sock \
-DDEFAULT_CHARSET=utf8 \
-DDEFAULT_COLLATION=utf8_general_ci \
-DWITH_MYISAM_STORAGE_ENGINE=1 \
-DWITH_INNOBASE_STORAGE_ENGINE=1 \
-DWITH_ARCHIVE_STORAGE_ENGINE=1 \
-DWITH_BLACKHOLE_STORAGE_ENGINE=1 \
-DWITH_MEMORY_STORAGE_ENGINE=1 \
-DWITH_READLINE=1 \
-DENABLED_LOCAL_INFILE=1 \
-DMYSQL_DATADIR=/db/mysql/data \
-DMYSQL_USER=mysql \
-DMYSQL_TCP_PORT=3306
＃ 編譯源碼，這一步時間會較長，耐心等待。
make
＃ 安裝
make install
＃ 清除安裝臨時文件
make clean
＃ 修改目錄擁有者
chown -R mysql:mysql /usr/local/mysql
chown -R mysql:mysql /db/mysql/data
＃ 進入安裝路徑
cd /usr/local/mysql
＃ 執行初始化配置腳本，創建系統自帶的數據庫和表。
scripts/mysql_install_db --user=mysql --datadir=/db/mysql/data
初始化腳本在 /usr/local/mysql/my.cnf 生成了配置文件。需要更改該配置文件的所有者：
chown -R mysql:mysql /usr/local/mysql
多說兩句：在啟動MySQL服務時，會按照一定次序搜索my.cnf，先在/etc目錄下找，找不到則會搜索"$basedir/my.cnf"，在本例中就是 /usr/local/mysql/my.cnf，這是新版MySQL的配置文件的默認位置！注意：在CentOS 6.4版操作系統的最小安裝完成后，在/etc目錄下會存在一個my.cnf，需要將此文件更名為其他的名字，如：/etc/my.cnf.bak，否則，該文件會干擾源碼安裝的MySQL的正確配置，造成無法啟動。
＃ 復制服務啟動腳本
cp /usr/local/mysql/support-files/mysql.server /etc/init.d/mysql
＃ 啟動MySQL服務
service mysql start
# 設置開機自動啟動服務
chkconfig mysql on
# 修改MySQL用戶root的密碼
mysql -u root
mysql>use mysql;
mysql>GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO root@"%" IDENTIFIED BY "root";
mysql>update user set Password = password('123456') where User='root';
mysql>flush privileges;
mysql>exit;
# 可選：運行安全設置腳本，修改MySQL用戶root（不是系統的root!）的密碼，禁止root遠程連接（防止破解密碼），移除test數據庫和匿名用戶，強烈建議生產服務器使用：
/usr/local/mysql/bin/mysql_secure_installation
后記：
2013年3月18日更新：
如果要使Windows平台下的MySQL和Linux平台下的MySQL協同工作，你需要設置Linux平台下的全局變量lower_case_table_names=1，強制將數據表名稱轉換為小寫（大小寫不敏感）。參考我另一篇博文：http://www.cnblogs.com/jlzhou/archive/2013/03/18/2966106.html