CentOS 5.5上安裝MPICH2

環境為CentOS 5.5，gcc-4.1.2

節點

• 192.168.111.150    gserver150
• 192.168.111.156    gserver156
• 192.168.111.157    gserver157
• 192.168.111.158    gserver158

192.168.111.150作為主節點，各節點用戶名統一為：geobeans。

1. 設置ssh無密碼登錄，參考(SSH無密碼登錄)

2.編譯安裝MPICH2

1) 下載mpich2（版本1.4.191）

http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/downloads/tarballs/1.4.1p1/mpich2-1.4.1p1.tar.gz

2) 編譯mpich2

$ tar zxvf mpich2-1.4.1p1.tar.gz
$ cd mpich2-1.4.1p1
$ ./configure --prefix=/opt/mpich2-1.4.1p1 --with-pm=hydra:mpd --with-mpe
$ make
$ sudo make install
mpich2-1.4.1p1的安裝目錄內容為：

/opt/mpich2-1.4.1p1/bin目錄為

3.配置MPICH2

安裝完MPICH2，需要對MPICH2進行配置。在每個節點上都必須配置。

1）配置環境變量（/etc/profile）

 $ sudo vi /etc/profile

在/etc/profile的底部添加下面幾行
export MPI_ROOT=/opt/mpich2-1.4.1p1
export PATH=$MPI_ROOT/bin:$PATH
export MANPATH=$MPI_ROOT/bin:$MANPATH

執行下面命令使/etc/profile生效

$ source /etc/profile

 

2) 測試環境變量

$ which mpd
$ which mpicc
$ which mpiexec
$ which mpirun

3）創建配置文件.mpd.conf

 root用戶和普通用戶的mpd.conf存儲位置是不同的。

  * root用戶

  root用戶下mpd.conf位於/etc路徑下，文件名為"mpd.conf"

* 普通用戶

   普通用戶的mpd.conf位於~/路徑下，文件名為".mpd.conf "。注意，文件名多了一個點

   mpd.conf的內容為secretword=myword

注意：各個節點上的mpd.conf文件必須相同

4）創建配置文件mpd.hosts

路徑：~/mpd.hosts。

內容：mpd.hosts記錄MPICH2集群上節點的機器名或IP地址。

例如：

 

5、啟動單點mpi

1) 執行命令

 $ mpd &

 2) 執行mpdtrace

6、啟動mpi集群

1) 關閉防火牆

 #service iptables stop

 查看防火牆狀態

#service iptables status

 2) 啟動mpi集群

$mpdboot -n 4 -f mpd.hosts -v

 啟動成功

3) 查看mpi集群

$mpdtrace -l

 

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8、FAQ

1）mpdboot_gserver150 (handle_mpd_output 421): failed to connect to mpd on gserver156

      場景：gserver156上的mpd已經啟動，gserver156上的設置與150上的設置一模一樣

      原因：~/.mpd.conf在各節點上的內容不一致時，可能出現這個問題

 

2）failed to handshake with mpd on gserver157

      原因： 防火牆沒有關

      解決：/sbin/service iptables stop

 

3）mpdboot_gserver156 (handle_mpd_output 426): from mpd on gserver158, invalid port info:

      原因：ssh無密碼登錄配置不對