對於多核程序，多線程對於程序的性能至關重要。 下面，我們將對Intel MKL 有關多線程方面的設置做一些介紹：
我們提到MKL 支持多線程，它包括的兩個概念：
1>MKL 是線程安全的： MKL在設計時，就保證它是一個線程安全的庫函數。 也就是說，無論是在單個線程中調用MKL函數，還是在多個線程中同時使用Intel MKL 函數，都能夠確保函數有正確的計算結果。
2>MKL函數內部實現了多線程優化。許多MKL的函數，已經包括內部多線程的實現。用戶調這些函數時，只需設置多線程的數目，MKL 函數的內部，就可以同時進行多個線程的並行計算。 Intel MKL 還提供了一個單線程版本的庫函數，這個版本中，每個函數只運行串行代碼。 我們需要在鏈接的時候，需要選擇鏈接串行（單線程）的MKL函數，還是並行（多線程）的MKL 的函數。 下面我們提到的多線控制的方法，主要是針對的並行的MKL函數庫。
那么，在MKL 的多線程庫中， 如何設置MKL 多線程的數目呢？ Intel MKL 使用了OpenMP實現了多線程，所以OpenMP的環境變量與API對MKL 的多線程設置仍然有效。 除了OpenMP的方法外，MKL還提供了，其它的設置多線程的環境變量與API:
| 環境變量 | 對應的API | 說明 | 對於的OMP的變量 |
| MKL_NUM_THREADS | mkl_set_num_threads | 建議MKL 函數使用的多線程的數目。. | OMP_NUM_THREADS |
| OMP_NUM_THREADS | omp_set_num_threads | OpenMP提供的多線程設置的環境變量與API. | |
| MKL_DYNAMIC | mkl_set_dynamic | 建議MKL根據計算問題，自動設置多線程的數目，線程數目不超過用戶設定的線程的上限 | OMP_DYNAMIC |
需要說明的是，Intel MKL 提供的多線程設置的方法，優先級要高於OpenMP的方法。 比程序中，同時設置了下面的環境變量：
>export MKL_NUM_THREADS =1
>export OMP_NUM_THREADS =4
此時，程序中，MKL的函數將會運行一個線程。
關於多線程的設置，我們還需要注意下面的3個問題：
第一，在超線程的機器上，Intel MKL 多線程的設置： 在系統中，當多個線程的執行不同的操作，CPU有空閑資源時，多線程技術有較好的執行效果。Intel MKL的計算核心已經經過充分優化，並且這些計算的核心都執行類似的計算操作，所有多線程的設置，對於MKL 不能提供很好的幫助。 如果在程序執行的機器上， 超線程的設置已經打開， 一個推薦的做法是，設置MKL 的線程為系統核的數目（邏輯處理器數目的一半），並設置下面的threading affinity 的環境變量：
KMP_AFFINITY=granularity=fine,compact,1,0.
第二，MKL_DYNAMIC 環境變量： 這個環境變量確定是否由Intel MKL 來選擇計算的線程的數目， 但是總的線程數不會超過MKL_NUM_THREADS與OMP_NUM_THREADS的值。 Intel MKL會根據實際計算問題的大小，以及多線程對計算是否有效等諸多情況，選擇適合的線程數目，這也是缺省的Intel MKL 多線程設置方式。
如果用戶手動設置MKL_DYNAMIC=FALSE， Intel MKL 將根據用戶指定的線程數目，設置計算線程。 比如，設置：
MKL_DYNAMIC=FALSE
MKL_NUM_THREADS=6
MKL函數將運行6個計算線程，盡管對某些小的計算問題，6個線程可能並不是最有效的。
第三，並不是所有MKL函數都是多線程。 某些計算函數，多線程並不能給程序帶來性能提升，如Level 1 BLAS，其主要計算瓶頸是數據訪問，這樣的函數，內部多線程，不能帶來很大幫助。 具體的MKL 多線程的函數列表， 可以查看用戶手冊。
有關多線程這方面的，進一步的參考文檔：
MKL 用戶手冊：http://software.intel.com/sites/products/documentation/hpc/mkl/mkl_userguide_lnx/index.htm
相關文章：
http://software.intel.com/en-us/forums/showthread.php?t=67622
http://software.intel.com/en-us/articles/intel-math-kernel-library-intel-mkl-intel-mkl-100-threading/
http://software.intel.com/en-us/articles/setting-thread-affinity-on-smt-or-ht-enabled-systems/