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基因或蛋白富集分析,gsea与ssgsea

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID、超几何富集分析等。都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

Sun Jul 05 20:40:00 CST 2020 0 4712
蛋白组学定量值得比较说明

1. Maxquant的iBAQ和LFQ,该用哪个?我们使用Maxquant做Label Free蛋白质组学定量分析的时候,在Maxquant的参数设置时,会遇到两个参数,LFQ和iBAQ,那么,选择 ...

Mon Oct 21 21:04:00 CST 2019 0 1368
UniProt数据库怎么看

由于蛋白质组学的发展,使得蛋白质数据库也日益丰富,数据库的专一性及综合性均增强,而且,通过超文本的链接,可以使多个数据库进行相互的衔接。目前,关于蛋白质的结构,蛋白质质谱等数据库均较多,今天 ...

Mon Jun 22 02:32:00 CST 2020 0 1032
蛋白组学之外泌体

1. 外泌体研究背景: 胞外囊泡是从细胞膜上脱落或者由细胞分泌的具有双层膜结构的囊泡状小体,主要由微囊泡、凋亡小体、外泌体组成。而外泌体是其中一类小囊泡,直径为30~150nm,密度1.10 ...

Thu Mar 26 19:09:00 CST 2020 0 999

 
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