plink 进行PCA分析
当我们进行群体遗传分析时,得到vcf后,可利用plink进行主成分(PCA)分析; 一、软件安装 二、使用流程 第一步:将vcf转换为plink格式 ...
当我们进行群体遗传分析时,得到vcf后,可利用plink进行主成分(PCA)分析; 一、软件安装 二、使用流程 第一步:将vcf转换为plink格式 ...
tructure是与PCA、进化树相似的方法,就是利用分子标记的基因型信息对一组样本进行分类,分子标记可以是SNP、indel、SSR。相比于PCA,进化树,群体结构分析可明确各个群之间是否存在 ...