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15、R语言聚类树的绘图原理

  聚类广泛用于数据分析。去年研究了一下R语言聚类树的绘图原理。以芯片分析为例,我们来给一些样品做聚类分析。聚类的方法有很多种,我们选择Pearson距离、ward方法。 选择的样品有: ...

Fri May 22 23:26:00 CST 2015 0 3734
附录3:RMA算法原理

RMA算法分三步: 一、背景校正(没精力写了) 二、归一化(没精力写了) 三、计算表达值 假设有5张芯片,这些芯片的某个探针组包含5个探针,它们的表达值如下: ...

Fri May 22 23:52:00 CST 2015 0 2673
05、解剖CEL文件各版本格式和读取方法(非R语言)

  相比DAT文件,网络上更支持CEL级别的文件。CEL已经把DAT图像转换成数据了,而且CEL比DAT所占空间小得多。介绍一下CEL文件的格式,CEL文件有文本文件(TextCelFile,版本3) ...

Fri May 22 22:18:00 CST 2015 0 2321

 
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