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BWA/BWT 比对软件

名称 bwa – Burrows-Wheeler Alignment Tool 内容 摘要 ...

Sun Jul 09 18:52:00 CST 2017 0 6091
【基因组学】maker的安装和注释

本文默认读者有一定的生信基础,没有基础的可以阅读以前的笔记内容。 ============================================================ con ...

Mon Jan 10 03:03:00 CST 2022 10 2842
samtools和bcftools使用说明

转自:http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 ...

Tue May 16 02:31:00 CST 2017 0 5153
[Linux] IGV使用说明

做完mapping之后,需要知道mapped reads在基因组上的分布,所以尝试在ubuntu系统中使用IGV软件,简单记录使用过程,如下:1.下载IGV软件  去IGV官网: http://www ...

Sat Mar 18 05:14:00 CST 2017 0 4245
SAM格式

SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。 不同的软件,不同的时期,不 ...

Thu Oct 25 18:13:00 CST 2012 1 8140
Annovar 信息注释

ANNOVAR 注释软件 ANNOVAR简介 ANNOVAR结构 ANNOVAR下载数据库 ANNOVAR输入格式 ANNOVAR格 ...

Sat Dec 30 00:13:00 CST 2017 0 2638
blast命令解释

原文链接:http://blog.csdn.net/bangemantou/article/details/7726585 Blast,全称Basic Local Alignment Search ...

Thu Oct 11 21:25:00 CST 2012 0 6783
【HiFi】CCS数据组装

2021年最后一个月了,里了无数flag,最后还是一事无成。 ===============割======================== 都2022年了,没时间伤感,还想和2021年一样吗? ...

Fri Dec 03 19:40:00 CST 2021 0 120
Integrative Genomics Viewer (IGV)

http://software.broadinstitute.org/software/igv/igvtools_commandline Running igvtools from the C ...

Sat Mar 18 00:41:00 CST 2017 0 1537
BED文件格式

BED 文件格式 BED 文件格式是一个可变方式的数据线,用来描述注释的数据。BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试 ...

Thu Aug 30 17:56:00 CST 2012 0 3336

 
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