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gff/gtf格式

1)gff3及gtf2简介 一个物种的基因组测序完成后,需要对这些数据进行解读,首先要先找到这些序列中转录起始位点、基因、外显子、内含子等组成元件在染色体中的位置信息(即注释)后才能再进行深入的分 ...

Sun Aug 19 00:36:00 CST 2018 0 6215
fasta/fastq格式解读

1)知识简介--------------------------------------------------------1.1)测序质量值 首先在了解fastq,fasta之前,了解一下什么是质 ...

Sat Aug 18 00:16:00 CST 2018 0 4505
blast及其格式输出简介

1)blast产生背景 双序列比对可以采用是基于动态规划算法的Needleman-Wunsch(NW)和Smith-Waterman algorithm(SW)算法,虽然精度高,但计 ...

Tue Aug 21 19:54:00 CST 2018 0 1501
bed文件格式解读

1)BED文件 BED 文件(Browser Extensible Data)格式是ucsc 的genome browser的一个格式 ,提供了一种灵活的方式来定义的数据行,以用来描述注释信息。B ...

Sun Aug 19 19:43:00 CST 2018 0 811
群体遗传之ped格式

1、PED简介 PED文件格式是广泛使用的用于连锁系谱数据分析的格式,并用作plink程序的输入。PLINK是一个免费的,开源的全基因组关联分析工集,旨在以高计算效率的方式执行一系列基本的,大规模的 ...

Mon Dec 16 06:38:00 CST 2019 0 245

 
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