MAD（Median absolute deviation, 中位数绝对偏差）
定义 MAD（Median absolute deviation, 中位数绝对偏差）是单变量数据集中样本差异性的稳健度量。mad是一个健壮的统计量，对于数据集中异常值的处理比标准差更具有弹性，可以大 ...
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somatic和germline突变有什么区别
Somatic突变是不遗传的，在研究方法上主要偏重采集癌症组织和正常组织进行比较得到结果（在Call Somatic mutations 的时候最好有同一个体的正常组织进行参照）从研 ...
最新HGVS基因突变命名规则速览
导读：随着二代测序技术临床应用的不断增加，越来越多与癌症发生发展密切相关的突变被鉴定出来。将基因突变的结果更好地转化为实际临床应用，统一而通用的突变命名规则就显得尤为重要。人类基因组变异协会（HGVS ...
VCF格式说明
VCF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文件，下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件，与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看，最上面#号注释的的部分是对一些参数的解 ...
用“limma”进行差异表达分析
1.概述 矩阵 函数 表达矩阵 lmFit 分组矩阵 eBayes ...