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CIRI 识别circRNA的原理

CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA, 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊; CIRI 根据3种模型来识别circRNA, 连接点处的read 叫做jun ...

Thu Apr 20 19:34:00 CST 2017 0 3111
circRNA 序列提取中的难点

在预测circRNA时,都是检测breakpoint 处的reads 数,最后给出的环状RNA的ID 都是诸如 chr14:106994222-107183708 这样的形式,给出了起始和终止位置; ...

Thu Apr 20 01:31:00 CST 2017 0 2528
find_circ 识别circRNA 的原理

find_circ 通过识别junction reads 来预测circRNA 和参考基因组比对完之后,首先剔除和基因组完全比对的reads,保留没比对上的reads, 这部分reads ...

Thu Apr 20 23:04:00 CST 2017 0 2407

 
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