edgeR:Empirical Analysis of Digital Gene Expression Data in R 一个差异性分析的R包，用于RNA-seq或DNA甲基化等相关技术分析。 ...

概述：tophat是以bowtie2为核心的一款比对软件。 tophat工作分两步： 1.将reads用bowtie比对到参考基因组上。 2.将unmapped-reads打断成更小的fr ...

goseq是一个R包，用于寻找GO terms，即基因富集分析。 GO terms是标准化描述基因或基因产物的词汇，包括三方面，cellular component,molecular funcit ...