先写简略版,以后再详细写。 1. 对输入结构进行预处理(refine) $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/ ...
先写简略版,以后再详细写。 1. 对输入结构进行预处理(refine) $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/ ...
安装RoseTTAFold完成后,进入example目录测试建模时,报错如下: 由于psipred运行错误导致预测二级结构出现错误,也不能继续向下执行。 解决方法如下: 1. 首先 ...
时间不充分,简单记录下自己实践过程中的做法: 1. 首先,非标准残基都需要转换成.params文件,使用 <path-to-Rosetta>/main/source/scripts/py ...
在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC c ...
1. 下载RoseTTAFold $ git clone https://github.com/RosettaCommons/RoseTTAFold.git (100M) ...
想起什么来写什么吧。 整体流程(以Ceas2, TPP, G3P为例): 准备蛋白即配体参数文件(pdb文件需要有header,header的顺序符合cst block的顺序,且residue1和 ...