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数据清洗—【trim_galore】那些事

Trim Galore是对FastQC和cutadapt的包装。适用于所有高通量测序,包括RRBS(Reduced Representation Bisulfite-Seq )、 Illumina、N ...

Tue Feb 22 01:03:00 CST 2022 2 2233
3.测序SRA数据下载与转换

一、官方下载工具Sratoolkit安装   推荐使用conda直接安装,避免配置环境的麻烦,但sratoolkit在conda镜像中的包名为sra-tools 二、SRA文件 ...

Sat Feb 19 00:54:00 CST 2022 0 1003
5.基因组索引文件创建—STAR

1.脚本 2.参数说明 3.注意事项  网上有评论说明STAR建立索引文件十分占用系统资源,利用slurm集群运算时可通过调整向系统寻求的资源数量避免该问 ...

Wed Feb 23 04:41:00 CST 2022 0 660

 
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