NGS检测SNP
1，Fastq数据质控 2,Fastq转化成bam，包含头文件 3,sam 转化成bam，如果SAM文件中有header @SQ lines。 4,sort b ...
原文：【变异检测】SNP INDEL检测
重测序SNP和INDEL变异检测主要有 套方案，samtools bcftools GATK assembly versus assembly .samtools bcftools方法 samtools和bcftools是我们做生信最常用的软件之一，功能非常的强大。这套软件组合可以单call，也可以群call来检测样本变异。单call提供一个样本，群call就提供多个样本。samtools bcf ...
2022-04-08 17:23 0 2454 推荐指数：
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