使用coloc进行QTL数据的共定位分析
共定位分析是一种用贝叶斯检验来分析两种可能相关的表型是否在给定区域内共享共同的遗传因果变异的方法，本文中，我们使用 coloc 包来进行共定位分析。 数据的准备 MAF的计算 我们的共定位的目的 ...
原文：文献阅读：me-QTL和p-QTL研究
背景： GWAS发现的与复杂疾病或性状关联的遗传变异大多数位于非编码区域，而大部分SNP的作用机制尚且未知，所以post GWAS时代中一个主要的挑战是理解和注释遗传变异与复杂性状 疾病关联的内在机制，而QTL研究是解构这种机制的一种重要研究方法，常见的QTL包括eqtl,pqtl,meqtl,sqtl等，其中最具代表性也是目前应用最广泛的QTL研究范式是表达数量性状座位分析 expression ...
2022-01-04 14:44 0 3640 推荐指数：
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