目录 1.简介 2.安装与配置 3.分析流程 4.结果 1.简介 PD全称Proteome Discoverer,是ThermoFisher在2008年 ...
外泌体 exosomes 是由哺乳动物细胞通过 内吞 融合 外排 等机制,主动向胞外释放的纳米级 直径 nm 双层囊泡小体,携带蛋白质 核酸 脂质等多种生物活性分子。越来越多的证据表明,外泌体是细胞间交流的重要媒介,它们可以将功能性分子转移到受体细胞中,或参与受体细胞膜受体介导的信号传导 。此外,由于外泌体在体液中很容易获得,常作为非侵入性液体活检的重要内容,以帮助识别疾病和评估治疗反应。而外泌体 ...
2021-08-11 15:56 0 167 推荐指数:
目录 1.简介 2.安装与配置 3.分析流程 4.结果 1.简介 PD全称Proteome Discoverer,是ThermoFisher在2008年 ...
目录 1.简介 2.下载安装 3.配置与运行 4.结果 5.Perseus后处理 6.小结 1.简介 2016年,德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQuant软件(MQ),并发表在nbt ...
目录 1.简介 2.安装运行 3.结果 1.简介 MSGF+也是近年来应用得比较多的蛋白鉴定软件。java写的,2008年初次发表JPR,2014年升级发表NC,免费开源,持续更新维护,良心软件。而且,有研究者对不同蛋白质组学鉴定软件进行比较分析 ...
1. 实验设计与技术路线 (1) 常用流程 流程 说明 1.材料收集 细胞、细胞上清、组织、血浆、血清、脑脊液、外泌体、尿液...... 2.定量技术 蛋白组:iTRAQ/TMT ...
缺失值填充在数据分析领域的预处理过程绕不过去的一个坎,蛋白质组学也不例外,简单记录下,可能有些地方有其特殊之处。 分析缺失值来源:完全随机缺失(MCAR,如质谱仪抖动,对数据影响无偏好性,均一分布),随机缺失(MAR,依赖于其他观测变量,如时间梯度越长采集越可能出现缺失值),非随机缺失 ...
当前,关于高通量蛋白质组学的研究远不如NGS这般火热,网上关于这方面的知识也寥寥无几,从事这一行也有一段时间了,但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训,所以是时候把知识点总结一下,权当复习。当然整个蛋白质组学研究也算纷繁复杂,不可能面面俱到,而且很多东西我也在学习当中,肯定会出现不少纰漏 ...
从事基于质谱的蛋白质组学信息分析也有一年多时间了,回过头来还是需要缕一缕这个领域的方方面面,温故知新。 简要概述 蛋白质组学(Proteomics)是研究一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质的统称。作为系统生物学中的重要组成部分,处于中心法则下游,相比于基因组和转录组学而言,发展比较缓慢 ...
1. 外泌体研究背景: 胞外囊泡是从细胞膜上脱落或者由细胞分泌的具有双层膜结构的囊泡状小体,主要由微囊泡、凋亡小体、外泌体组成。而外泌体是其中一类小囊泡,直径为30~150nm,密度1.10~1.18 g/ml,可携带核酸、蛋白质质和脂质等,存在于血液、唾液、尿液等多种体液中 ...