目录 研究一：G19833组装，2014NG 研究二：BAT 93组装，2016 genome biology 菜豆属（Phaseolus L.）为同源二倍体作物，包含有80 多个物种，多数为野生种，仅有5 个栽培种，分别为普通菜豆（P. vulgaris ...

目录 一、来源 二、结果 测序组装 组装评价 编码基因预测 基因功能注释 非编码RNA注释 假基因预测 重复序列注释 进化分析和分歧时间估计 全基因组复制 LTR插入时间估计 ...

目录 来源 一、简介 二、结果 基因组组装 重复序列和转座子 基因组特征和基因注释 绿豆的驯化 豆科基因组复制历史 基于转录组分析的豇豆属形成 绿豆育种基因组资源 三、讨论 四、方法 ...

基因组注释主要包括四个研究方向：重复序列的识别；非编码RNA的预测；基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义：重复序列可分为串联重复序列（Tendam repeat）和散在重复序列 ...

目录 一、前沿概述 二、主要结果 重测序、组装与注释 泛基因组 SV特征 PAV与古多倍化，WGD事件 基因SV与基因融合 SV与大豆驯化 SV影响基因表达及其与性状关联 一、前沿概述 ...

参考基因组版本命名参考基因组联盟（Genome Reference Consortium），它是由 NCBI，EBI，桑格研究所等机构组成。GRC 利用最佳的技术装配，纠正，增加基因组序列，以此作为在生信分析领域作为参考的基因组。人基因组官名叫 GRCh38 （Genome ...

植物vs动物总结版： 简述高等植物基因组（可以以拟南芥和水稻基因组为例）与高等动物基因组（可以以人类、果蝇等基因组为例）在基因结构层面展示出来的基本差异。 高等植物基因组与高等动物基因组在基因结构上的基本差异主要是生命组学的第一困境，即复制-转录负载困境。 机制： 1.从平衡流 ...

NextDenovo 是有武汉未来组团队开发出来用于组装ONT，Pacbio, HIFI (默认参数可对60-100X数据更有效)，可通过correct--assemble对其进行组装。组装后， ...