经常会想到用热图来展示某个基因或某些基因的表达量问题,今天用R中pheatmap包一步步绘制热图。 第一步:公众路径设置,调用包pheatmap,读取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入绘制热图(图1-图15) 一建热图(图1) p<-pheatmap(data ...
pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类热图的R包。常用参数介绍基础设置main 图的名字file 要保存图的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择 绿,黑,红 渐变,分为 个等级,,例:color colorRampPalette c navy , white , firebrick sc ...
2021-06-14 17:10 0 1694 推荐指数:
经常会想到用热图来展示某个基因或某些基因的表达量问题,今天用R中pheatmap包一步步绘制热图。 第一步:公众路径设置,调用包pheatmap,读取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入绘制热图(图1-图15) 一建热图(图1) p<-pheatmap(data ...
载入包 载入数据 绘制热图 生成行列注释 ...
http://www.sohu.com/a/319918959_278730 http://www.dxy.cn/bbs/thread/34987035?sf=2&dn=4#34987 ...
1.matplitlib绘制热图 2.Seaborn绘制热图 ...
生成测试数据 绘图首先需要数据。通过生成一堆的向量,转换为矩阵,得到想要的数据。 ...
使用ggplot2在地图上绘制热力图 ...
无论是直方图还是经验分布图,要从比较上鉴别样本是否处近似于某种类型的分布是困难的 QQ图可以帮我们鉴别样本的分布是否近似于某种类型的分布 R语言,代码如下: > qqnorm(w);qqline(w)> w <- c(75.0, 64.0 ...
热图可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木,拼凑出你最喜欢的热图即可,如下图: 基因和样本都可以单独聚类,排序,聚类再分组,行列注释,配色 ...