原文:HISAT2 下载和使用

HISAT 官网https: daehwankimlab.github.io hisat HISAT 下载 https: daehwankimlab.github.io hisat download Binaries Version: HISAT . . Release Date: Source https: cloud.biohpc.swmed.edu index.php s fE QCsX N ...

2021-06-10 21:34 0 1641 推荐指数:

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Hisat2 bowtie2比对结果解读(Hisat2 Alignment summary)

RNA-seq数据的比对结果怎么解读?网上有很多人问,这里做一个大致的总结。 Hisat2和bowtie2比对后产生的Alignment summary的格式是一样的,如下: Alignment summary When HISAT2 finishes running, it prints ...

Sun Mar 11 01:34:00 CST 2018 0 6401
RNA-Seq基因组比对工具HISAT2

原文网址: http://blog.biochen.com/archives/337 HISAT2是TopHat2/Bowti2的继任者,使用改进的BWT算法,实现了更快的速度和更少的资源占用,作者推荐TopHat2/Bowti2和HISAT的用户转换到HISAT2。官网:https ...

Thu Jul 19 23:07:00 CST 2018 0 1289
HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据

HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据 本文总阅读量次2017-05-26 HISAT2,StringTie,Ballgown处理转录组数据思路如下: 数据质控 将RNA-seq的测序reads使用hisat2比对 samtools ...

Sat Nov 10 05:46:00 CST 2018 0 1422
HISAT2+StringTie+Ballgown安装及使用流程

HISAT2+StringTie+Ballgown安装及使用流程 2015年Nature Methods上面发表了一款快速比对工具hisat,作为接替tophat和bowtie的比对工具,它具有更快的比对速度和更高的比对率,最近把这个流程走完一遍,感觉优势还是很明显的。 一、HISAT2 ...

Sat Nov 10 05:51:00 CST 2018 0 3946
Valgrind下载、安装和使用

下载 valgrind-3.15.0.tar.bz2 CSDN资源 百度网盘 提取码: e7hf 安装 使用 1、检查是否有内存泄露 下图显示 [ 没有error,warning,但是却发生了内存泄露 ] ,因此,需要进行手动释放 malloc 开辟的空间 ...

Thu Aug 22 00:46:00 CST 2019 0 807
 
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