原文:LAMMPS中的系综(NPT/NVT)命令

语法: ID 是fix名,group ID是fix所作用的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。 style name可以选择NVT NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 例子: 详细说明: 这些命令用来对Nose Hoover型的non Hamiltonian运动方程进行时间积分。该运动方程用以从正则系综 等温等压系综 等焓系综采样生成原子的位置和速度,从而对所 ...

2021-04-10 08:12 0 855 推荐指数:

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系综的实现方式(nve、nvtnpt

一、NVE系综 更新位置和速度,v和e恒定。 二、NVT系综 几种实现的方式: 如: fix 1 all nve #更新位置和速度,e和V保持不变。若只有这个命令,就只nve系综,如果和控温命令一起,就是nvt系综。fix 2 all langevin 298.0 298.0 ...

Sun May 05 00:19:00 CST 2019 0 2968
lammps--命令注意

1.create_box  这个关键字看似简单实则让人难受。   ①在写这个关键字的时候切记:一一对应原则,即:     bond/types  对应  extra/bond/per/atom ...

Fri Jul 10 04:09:00 CST 2020 0 579
Lammps命令与in文件

LAMMPS 即 Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator (大规模原子分子并行模拟器),是由美国能源部桑迪亚国家实验室开发的一种开源的经典分子动力学模拟代码 in 文件描述一个符合牛顿定律的模拟过程,内容大致包含三个 ...

Tue Jan 08 04:33:00 CST 2019 3 3224
lammpsfix deform的理解

fix 5 all deform 1000x erate 0.002 units box #设置沿x方向拉伸,应变率为0.002(1/ps) fix ID group-ID deform N p ...

Mon Sep 30 16:29:00 CST 2019 0 793
lammps计算的应力的方法

摘自:http://dxli75.blog.163.com/blog/static/106768289201142893419587/ lammps计算的应力有两种: 一是体系整体的应力状态,通过在thermo_style custom里加上pxx pyy pzz pxy pxz pyz字段 ...

Sun May 05 00:37:00 CST 2019 0 2196
lammps_data文件

一、notes: 1、不在data文件里写“#”(注释),否则,容易出错; 2、前两行不用写东西(建议); 3、相互作用系数可以不用写在data里边(如pair_coeff等),可有可无,but for pair_coeff,最好还是在data文件设定,因为它比在in文件设定更加方便 ...

Sat May 04 23:46:00 CST 2019 0 1669
lammps温度云图

转自:小木虫 田淮安 的回答。 LAMMPS的温度是由原子的动能计算而来的,具体可参见手册compute temp command一节的说明。LAMMPS的模拟结果,我这里指的是dump命令得到的lammpstrj文件,主要内容都是每个时刻每个原子的信息,包括坐标、速度、动能、势能 ...

Fri Jun 26 00:04:00 CST 2020 4 2215
 
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