目录 C简介 技术类型及区别 数据下载 基本应用 C简介 核心理念就是把真核细胞核里的DNA三维折叠结构给测序出来，一个最经典的模型就是远距离enhancer可以促进转录。 真核生物细胞核中的染色质通过折叠成高度动态 复杂的高级结构，调控基因的转录 复制，以及损伤修复等重要功能。理解染色质在细胞核内如何折叠，基因组的三维空间结构如何调控基因转录 复制和修复等生物学功能，以及探索核染色质在遗传 发育 ...
2021-03-01 17:12 0 616 推荐指数：
RNA-seq这个工具该什么时候用？ATAC-seq该什么时候用？有相当一部分项目设计不行，导致花大钱测了一些没有意义的数据。 还是在中心法则这个框架下来解释，这是生物信息的核心。打开华大科技服务官网梳理一下现在到底都有些什么测序技术： 全基因组测序和重测序 - 组装以及寻找变异 ...
染色质可及性（Chromatin accessibility）是核内大分子能够物理接触染色质化DNA的程度，由核小体的占据和拓扑结构以及阻碍DNA可及性的其他染色质结合因子决定。 ...
技术，实现了全基因组范围内染色体片段间相互作用的捕获。Hi-C 除了用于辅助基因组组装、对已组装的基因 ...
首先在这里先感谢我们【Bio生信学习交流群】的群友和创建此群的群主【陈博士后】。 今天解决的问题是怎么查看自己的基因组数据是哪个Genome Reference Versions。 步骤： 第一步，打开你的基因组数据bim文件（Plink格式），随便找一个 ...
源地址 1 概述 1.1 什么是捕获组 捕获组就是把正则表达式中子表达式匹配的内容，保存到内存中以数字编号或显式命名的组里，方便后面引用。当然，这种引用既可以是在正则表达式内部，也可以是在正则表达式外部。 捕获组有两种形式，一种是普通捕获组，另一种 ...
基因组里的小写字母的序列就是soft masking，也就是被标记的重复序列。 怎么把重复序列提取出来，保存为bed文件？ 参考：Uppercase vs lowercase letters in reference genome ...
1.染色质开放性测试技术 https://zhuanlan.zhihu.com/p/31924355 首先正常的DNA都是卷起来的，只有在表达时才会展开，也就是开放，术语上说就是具有可接近性，那么ATAC-seq就是测这些染色质开放性的技术。 原理： 人为地将这些DNA序列 ...
表观遗传 表观遗传的3个机制：DNA甲基化；组蛋白修饰；chromatin remodeling 开放染色质测序： 参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/49461012 研究目的：研究细胞的转录调控。 细胞的大部分时间处于 ...
