群体遗传参数
1 Theta (\( \theta \)) 群体遗传学中，在中性 Wright-Fisher 模型 (neutral Wright-Fisher model) 下，尺度参数为 \[\theta = 4N\mu\] 为每世代平均突变数的两倍。其中，\(N\) 为有效群体大小 ...
原文：【群体遗传】PopART 绘制 Haplotype Network 图解(By Raindy)
转载于：http: blog.sciencenet.cn home.php mod space amp uid amp do blog amp id 絮语： 重建单倍型网络是群体遗传学的一个重要分析内容，最常用的分析工具有Network TCS等，但不同工具都有相应的优缺点，具有详见日志后的参考文献，本文不作赘述。 本文介绍一款全能型的单倍型网络重建工具 PopART，该软件整合了多种不同的单倍型 ...
2021-01-20 13:57 0 608 推荐指数：
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--out test_out 群体遗传学中，经常提到群体间随机交配，随机交配是Hardy-We ...
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1）将vcf转化为plink格式，假定输入的vcf文件名为：17893893-17898893.vcf,也可以参考链接：将vcf文件转化为plink格式并且保持phasing状态 /vcfto ...
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群体遗传学习笔记-基础篇
链接：https://www.jianshu.com/p/c489da8e75ff 群体遗传学介绍 传统群体遗传学是基于观察到的等位基因频率与预期频率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下，你可能会看到有性繁殖的二倍体个体群体，而且这些种群没有重叠世代。该模型 ...
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