需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群的taxonomy数据库文件来匹配。一般下载下来的数据库会有 ...
目录 需求 实现 需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群的taxonomy数据库文件来匹配。一般下载下来的数据库会有names.dmp和nodes.dmp文件,分别是物种层级关系文件和taxid与物种名对应文件。但我 ...
2020-12-30 11:58 0 486 推荐指数:
需求 我有一个物种taxonomy ID的list,想获得相应的物种名,不要一个个去NCBI Taxonomy官网查。反之根据物种名list查询对应的taxid。 实现 因为之前没怎么用过,我的第一个想法是通过下载到集群的taxonomy数据库文件来匹配。一般下载下来的数据库会有 ...
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