原文:scRNAseq benchmark 学习笔记

背景 把早年没填完的坑 单细胞测序的细胞类型鉴别 给重新拾起来 其Github描述的基本情况: 作者并不对单个分类器进行说明,统一包装在benchmark工程里,还建立了docker容器 但说明了在scripts里有封装好的方法,可以直接读入数据进行分类 可以使用,但是整个过程需要知道,读全文 回顾文章 . 文章采用的方法和数据集介绍 参考表格 个方法, 个数据集 前十一个用于数据集内比较不同方法 ...

2020-11-05 19:57 0 406 推荐指数:

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什么是 baseline 和 benchmark

  baseline 一个算法被称为 baseline 算法说明这个比目前这个算法还差的已经不能接受了,方法有革命性的创新点可以挖掘,且存在巨大提升空间和超越benchmark的潜力,只是由于发展初期导致性能有限。所以baseline有一个自带的含义就是“性能起点 ...

Sun Sep 12 01:14:00 CST 2021 0 209
FIO Benchmark

一、简介 FIO为Linux kernel的IO部分维护者axobe开发, Github: https://github.com/axboe/fio。FIO的详细使用方法参见自带的HOWTO文件。 FIO一种IO系统的Benchmark和压力测试工具,可以模拟不同IO场景下的IO ...

Mon Mar 13 23:04:00 CST 2017 0 3280
Google benchmark

Google benchmark 1.测量开发的某一段代码的性能; 2.开发性能测试程序 reference: https://github.com/google/benchmark.git https://blog.csdn.net/Tornado1102/article ...

Fri Feb 18 22:41:00 CST 2022 0 851
学习笔记1

  参加工作一年多了, 但是总觉得技术没有什么长进,最近出去面试,总结出的面试的问题。开始面试的是一家小公司,问了项目的用的技术,我说了的git、maven、springMVC,mybatis, 以 ...

Mon Oct 10 17:09:00 CST 2016 7 435
scRNA-seq数据获得(R包scRNAseq

R bioconductor中的scRNAseq数据包是专门提供scRNA-seq数据的包。 1.Introduction scRNA-seq包提供了一个方便的途径来获得公开的数据集,这些数据集是以SingleCellExperiment 格式存储的。 查看表达数据矩阵: 2. ...

Thu Jan 07 01:21:00 CST 2021 0 629
 
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