GSEABase | clusterProfiler | GSEA富集分析 | MSigDB
2023年09月01日 log2FC <- log2(rowMeans(TPM[,high.samples])+1) - log2(rowMeans(TPM[,low.sample ...
原文：clusterProfiler
clusterProfiler也是通过KEGG API去获取物种对应的pathway注释，对于已有pathway注释的物种，我们只需要知道对应的三字母缩写， clusterProfiler就会联网自动获取该物种的pathway注释信息。 在clusterProfiler中，enrichKEGG KEGG通路 和enrichMKEGG KEGG模块 支持下载最新的在线版本的KEGG数据进行富集分析。 ...
2020-11-01 21:53 0 525 推荐指数：
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