利用plink软件基于LD信息过滤SNP
最近有需求，对WGS测序获得SNP信息进行筛减，可问题是测序个体少，call rate，maf，hwe，等条件过滤后，snp数量还是千万级别，所以后面利用plink工具根据LD信息来滤除大量SNP标记。 工具版本：PLINK v1.90b4.6 64-bit (15 Aug 2017) 一、格式 ...
原文：plink 软件中 --recode 01、--recode 12、--output-missing-genotype的作用
准备测试数据， 个样本， 个位点 recode recode recode output missing genotype 结论： recode :将次等位基因变为 ，主等位基因变为 recode ：需结合 output missing genotype使用，将次等位基因变为 ，主等位基因变为 ， output missing genotype作用是设定缺失基因型的代表字符。 ...
2020-10-10 20:58 0 649 推荐指数：
相关推荐
Idea01 Idea2018中集成Tomcat9导致OutPut乱码
版本和平台 idea2018.3 tomcat9 jdk1.8 windows7 64位 output乱码 经过测试，项目编码格式设置为utf-8，在main方法中输出中文正常。 而iedea集成tomcat后，output输出启动日志信息乱码，经过判断，该乱码源于 ...
httprunner 2.x学习12-在testcase中传递变量(output)
前言 httprunner 2.x 的版本，testcase 可以引用 api, 同样的 testcase 也可以引用另外一个 testcase 文件 在2个 testcase 中传递变量可以用到 output 关键字 testcase 导入 api 测试用例（testcase) 是测试步骤 ...
plink软件计算位点杂合度和样本杂合度
杂合度计算分为两种：位点杂合度和样本杂合度 1、计算位点杂合度，测试数据如下: 2、--hardy计算位点杂合度 2、--het 计算样本杂合度 ...
PCA 主成分分析实践 plink软件
。 2、运行plink软件，命令如下： plink --file test --sheep --pca 5 h ...
浏览器F12，Network中各按钮的作用
Network下 preserve log:勾选，页面发生跳转，接口不丢失；（比如登录成功跳转到首页，登录的接口就没了,勾选Perserve log，会记录跳转前的接口）； Disable ...
sql中out与output
, --numB为另一参数 @numReturn int output --此为Out ...
01-12 56—60
56、从0-99这100个数中随机取出10个，要求不能重复，可以自己设计数据结构 57、介绍一下try except的用法和作用? 58、在python中如何抛出，捕获，处理异常？ 59、enumerate 的作用是什么? 60、lambda 表达式格式以及应用场景? ...