原文:火山图

分析背景 火山图常用于转录组研究中,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一种,它能将统计学中的统计显著性量度 如p value,矫正后的P值 和变化幅度相结合,从而能够帮助人们识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据 如基因,蛋白等 ,如下图所示。 图形分解 图中每一点代表所研究的基因,灰色的点代表这些基因在实验组和对照组的表达情况不具有差异性,绿色和红色的点代表 ...

2020-09-03 10:35 0 672 推荐指数:

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如何看懂火山

如何看懂火山 下面我们就说明下如何看懂和绘制火山。 标准的火山常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P<0.05,差异表达一般我们按照Fold Change ...

Thu Aug 13 05:46:00 CST 2020 0 612
绘图技巧 - 火山 | volcano plot

标签:RNA-seq;基因表达 一个非常常见的种,用于表示两组数据基因表达差异的,通常横纵坐标分别为 Log2FC 和 P-value。 画出来并不难 美化稍微有点难度:标注重要的点,点的颜色、形状、图层顺序。 基本数据准备: 带log2FC ...

Fri Jan 08 00:19:00 CST 2021 0 413
GGPLOT2-plotly |让你的火山“活”过来

火山(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为P值(P值),值越大差异越显着。原因得名也许的英文因为查询查询结果图像火山吧 一载入R函数包及数据集 library(ggplot2)data ...

Fri Jul 26 05:49:00 CST 2019 0 1104
扩增子图表解读5火山:差异OTU的数量及变化规律

火山 Volcano plot 在统计学上,火山是一种类型的散点图,被用于在大数据中快速鉴定变化。由于它的形成像火山喷发的样子,所以被称为火山。和上文讲的曼哈顿类似。 火山基本元素 火山也有很多种样式,在生 ...

Thu Aug 03 08:10:00 CST 2017 0 1999
火山 【第一篇】基础

火山手册 环境搭建 下载火山开发软件 www.lkuaiy.com http://voldp.com/ 安装 第一个火山程序 概念和界面 概念 界面 界面事件和按钮控件 界面事件 按钮控件 按钮事件 ...

Thu Nov 12 18:56:00 CST 2020 0 2752
字节跳动:抖音、西瓜、火山区别

抖音、西瓜视频和火山小视频都是字节跳动旗下的短视频app,很多人不清楚为何字节跳动要做这么多款视频类app,它们究竟是“同质化”程度过高? 还是差异化定位用户群体?是内部互相竞争抢占市场还是共同开拓,占领更多的市场? 接下来我将带着这些疑惑,逐一体验这三个app并针对性的分析 ...

Thu Dec 17 06:30:00 CST 2020 0 454
火山引擎云产品发布会活动资讯

火山引擎云产品发布会成功召开,正式宣布进军云市场 字节跳动正式对外发布火山引擎全系云产品。12月2日,火山引擎「新云·共未来」云产品发布会在上海成功召开。这是火山引擎在升级为字节跳动企业级技术服务业务板块之后,首次正式亮相并发布全系云产品。 发布会上,字节跳动副总裁杨震原发表了题为《字节 ...

Fri Dec 03 04:07:00 CST 2021 0 231
 
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