原文:微生物群落多样性测序与功能分析

微生物群落多样性测序与功能分析 .几个概念: S rDNA 或 S rRNA OTU 测序区段。 . 测序区段:由于 S rDNA较长 . kb ,我们只能对其中经常变化的区域也就是可变区进行测序。 S rDNA包含有 个可变区,分别是v v 。一般我们对v v 双可变区域进行扩增和测序,也有对v v 区进行扩增测序。 .工具 原料: . 样本: S rDNA测序首先需要提取环境样品的DNA,这些 ...

2020-08-30 23:12 0 734 推荐指数:

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微生物测序样本准备方法总结

微生物测序中,样本的准备从根本上是确保获得高质量DNA的前提,而样本准备也正是让众多微生物科研工作者感到困扰的重要一步。今天就给大家分类介绍一下常见的微生物样本类型及采样方法 微生物测序样本准备方法 医口样本 ...

Thu Aug 03 08:14:00 CST 2017 0 2212
微生物组与代谢组关联分析

://github.com/chentianlu 另外,想要代谢入门的同学可读读她写的代谢组学数据分析综述 ...

Sat Dec 12 02:49:00 CST 2020 0 554
微生物+计算细胞倍增时间

TOP ## 1 简介 虽然做生长曲线和求代际时间貌似是个很简单常规的东西,可是到我一直不大确定自己求的对不对... 这次下定决心不再乱做... 不看解释,跳到[作图](#tag) ## 2 定义 ### 微生物 * 细菌,真菌 培养和测定 细菌:液体培养,不同的时间测定OD600 ...

Wed Sep 06 22:40:00 CST 2017 0 2280
微生物-细菌-葡萄球菌

细菌-葡萄球菌 葡萄球菌葡萄球菌是一群革兰氏阳性球菌,因常堆聚成葡萄串状,故名。多数为非致病菌,少数可导致疾病。葡萄球菌是最常见的化脓球菌,是医院交叉感染的重要来源,菌体直径约0.8μm,小球形,但在液体培养基的幼期培养中,常常分散,细菌细胞单独存在。葡萄球菌病主要是由金黄色葡萄球菌引起的家禽 ...

Tue Mar 01 16:59:00 CST 2022 0 658
多样性计算的各种距离

Beta多样性和生态相似 Beta多样性(β多样性,Beta diversity),即在一个梯度上从一个生境到另一个生境所发生的种的多样性变化的速率和范围,它是研究群落之间的种多度关系。Beta多样性本身代表了一个复杂的问题,可以被视为物种更替(物种沿空间、时间或环境梯度的定向过程 ...

Fri Dec 27 03:57:00 CST 2019 0 1234
推荐系统多样性

  来自于:Joseph A. Konstan & John Riedl   推荐系统还有另外两大特点,也对你最终看到的推荐结果有着显著的影响:第一,在弄清楚你和其他购物者的相似度有多高之前 ...

Mon Feb 29 22:42:00 CST 2016 0 2405
 
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