原文:如何看懂火山图

如何看懂火山图 下面我们就说明下如何看懂和绘制火山图。 标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P lt . ,差异表达一般我们按照Fold Change 倍数变化 gt . 作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和倍数后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log 的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的 倍,log ,同样的如果是 ,也就是 . ,转换后的结 ...

2020-08-12 21:46 0 612 推荐指数:

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火山

分析背景     火山常用于转录组研究中,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一种,它能将统计学中的统计显著性量度(如p value,矫正后的P值)和变化幅度相结合,从而能够帮助人们识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据(如基因,蛋白等),如下图所示 ...

Thu Sep 03 18:35:00 CST 2020 0 672
绘图技巧 - 火山 | volcano plot

标签:RNA-seq;基因表达 一个非常常见的种,用于表示两组数据基因表达差异的,通常横纵坐标分别为 Log2FC 和 P-value。 画出来并不难 美化稍微有点难度:标注重要的点,点的颜色、形状、图层顺序。 基本数据准备: 带log2FC ...

Fri Jan 08 00:19:00 CST 2021 0 413
GGPLOT2-plotly |让你的火山“活”过来

火山(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为P值(P值),值越大差异越显着。原因得名也许的英文因为查询查询结果图像火山吧 一载入R函数包及数据集 library(ggplot2)data ...

Fri Jul 26 05:49:00 CST 2019 0 1104
如何看懂时序

时序是一个IC器件的精华,看懂了时序,基本上就可以运用这个器件了。 传送门:https://www.cnblogs.com/qsyll0916/p/7711098.html 操作时序永远使用是任何一片IC芯片的最主要的内容。一个芯片的所有使用细节都会在它的官方器件手册 ...

Sat Jan 29 23:50:00 CST 2022 0 2671
看懂16个英语时态

英语的时态由 4时: 现在时, 过去时, 将来时, 过去将来时; 4态: 一般 , 进行, 完成, 完成进行; 两两组合, 形成英语的 16 个时态. 动词有, 原型, 过去式, ...

Thu Jul 19 00:11:00 CST 2018 2 8781
从IDEA角度来看懂UML

前言 我们目前已经学习了设计模式的7种设计原则。下面本该是直接进入具体的设计模式系列文章。 但是呢在我们学习设计模式之前我们还是有必要了解一下uml。因为后续的设计模式文章不出意外应该会很多地方使用到uml。如果你连uml都看不懂的话,那么学习起来肯定会有一定的难度。 所以说,这一 ...

Sat Aug 17 22:18:00 CST 2019 5 1186
带你看懂什么是智慧城市

智慧城市就是运用信息和通信技术手段感测、分析、整合城市运行核心系统的各项关键信息,从而对包括民生、环保、公共安全、城市服务、工商业活动在内的各种需求做出智能响应。其实质是利用先进的信息技术 ...

Fri Dec 25 08:36:00 CST 2020 0 1011
fiddler 看懂瀑布Timeline

请求、接受数据等阶段。把多个请求以时间作为 X 轴,用图表的形式展现出来,就形成了瀑布。在 Fidd ...

Tue Oct 16 21:09:00 CST 2018 0 1042
 
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