分析背景 火山图常用于转录组研究中,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一种,它能将统计学中的统计显著性量度(如p value,矫正后的P值)和变化幅度相结合,从而能够帮助人们识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据(如基因,蛋白等),如下图所示 ...
如何看懂火山图 下面我们就说明下如何看懂和绘制火山图。 标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P lt . ,差异表达一般我们按照Fold Change 倍数变化 gt . 作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和倍数后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log 的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的 倍,log ,同样的如果是 ,也就是 . ,转换后的结 ...
2020-08-12 21:46 0 612 推荐指数:
分析背景 火山图常用于转录组研究中,也能应用于基因组,蛋白质组,代谢组等统计数据。它归根到底是是散点图的一种,它能将统计学中的统计显著性量度(如p value,矫正后的P值)和变化幅度相结合,从而能够帮助人们识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据(如基因,蛋白等),如下图所示 ...
标签:RNA-seq;基因表达 一个非常常见的图种,用于表示两组数据基因表达差异的图,通常横纵坐标分别为 Log2FC 和 P-value。 画出来并不难 美化稍微有点难度:标注重要的点,点的颜色、形状、图层顺序。 基本数据准备: 带log2FC ...
火山图(Volcano Plot)常用于展示基因表达差异的分布,横坐标常为Fold change(倍数),越偏离中心差异倍数越大;纵坐标为P值(P值),值越大差异越显着。原因得名也许的英文因为查询查询结果图像火山吧 一载入R函数包及数据集 library(ggplot2)data ...
时序图是一个IC器件的精华,看懂了时序图,基本上就可以运用这个器件了。 传送门:https://www.cnblogs.com/qsyll0916/p/7711098.html 操作时序永远使用是任何一片IC芯片的最主要的内容。一个芯片的所有使用细节都会在它的官方器件手册 ...
英语的时态由 4时: 现在时, 过去时, 将来时, 过去将来时; 4态: 一般 , 进行, 完成, 完成进行; 两两组合, 形成英语的 16 个时态. 动词有, 原型, 过去式, ...
前言 我们目前已经学习了设计模式的7种设计原则。下面本该是直接进入具体的设计模式系列文章。 但是呢在我们学习设计模式之前我们还是有必要了解一下uml图。因为后续的设计模式文章不出意外应该会很多地方使用到uml图。如果你连uml图都看不懂的话,那么学习起来肯定会有一定的难度。 所以说,这一 ...
智慧城市就是运用信息和通信技术手段感测、分析、整合城市运行核心系统的各项关键信息,从而对包括民生、环保、公共安全、城市服务、工商业活动在内的各种需求做出智能响应。其实质是利用先进的信息技术 ...
请求、接受数据等阶段。把多个请求以时间作为 X 轴,用图表的形式展现出来,就形成了瀑布图。在 Fidd ...