Bowtie2的安装与使用
Bowtie2的安装与使用 2017-06-15 18:58:52 342 0 0 Bowtie2用来快速比对短reads(50-100bp)与参考基因组，与常规的比对软件不同的是（如blast），Bowtie在比对比较短的reads（less ...
原文：bowtie和bowtie2使用条件区别及用法
转载自：https: blog.csdn.net soyabean article details 一 转录组还是基因组 map常用的工具有bowtie bowtie , BWA,SOAP SOAP 等。这个问题又会被分成两个问题，是基因组测序 DNA seq 还是转录组测序 mRNA seq 。其中的区别是对于真核生物而言，mRNA序列与DNA序列并不完全相同，在经历了后剪切之后，成熟的mRNA ...
2020-06-10 10:16 0 783 推荐指数：
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主要简述 bowtie2 的入门用法，完成从原始序列到最后完成mapping 之后的 sam格式文件。 参考文档 最重要的参考文档还是官方文档： Bowtie2-mannual Getting started with Bowtie 2 文献: Fast ...
bowtie2 Linux安装
目前最新版本为2.3.2，网址为：https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.2 安装分为简单的下载可执行文件和源编译安装。 如上图所示，bowtie2-2.3.2-source.zip为源代码，需要用 ...
bowtie2-inspect 根据bowtie2的索引取得fasta 序列
/Human/hg19/bowtie2_db/hg19.fa.fa [2016-02-27 11:40: ...
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Bowtie使用介绍 转载自：http://bioinformation.cn/?p=316 Bowtie（下载）是一个超级快速的，较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时，可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具 ...
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