PCA 主成分分析实践 plink软件
。 2、运行plink软件，命令如下： plink --file test --sheep --pca 5 h ...
原文：plink 进行PCA分析
当我们进行群体遗传分析时，得到vcf后，可利用plink进行主成分 PCA 分析 一 软件安装 二 使用流程 第一步：将vcf转换为plink格式 上述会得到.map, .nosex和.ped结尾的三个文件。 第二步：基于.ped生成一个bed文件 二进制文件 上述得到.bim, .bed 结尾的两个文件 第三步：PCA分析 上述得到.eigenval 和.eigenvec 结尾的两个文件，其中. ...
2020-04-26 14:00 0 3506 推荐指数：
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