在生信处理流程中,从最初的fastq文件,经过分析处理后,会生成一堆的后续文件,如何在流程中合理的命名呢? 通常在批处理模式中,我们会得到多个样本*.fastq(或*.fq、*.fastq.gz、*.fq.gz)路径名文件sample.txt。如下所示: 上述,是一个 ...
最近写脚本,需要对脚本中函数传递的路径参数进行截取,发现了以下比较好用的方法,记录下: file dir dir dir my.file.txt 我们可以用 分别替换获得不同的值: file :拿掉第一条 及其左边的字串:dir dir dir my.file.txt file :拿掉最后一条 及其左边的字串:my.file.txt file . :拿掉第一个.及其左边的字串:file.txt f ...
2020-04-16 21:38 0 1704 推荐指数:
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文件路径截取: endswith(): ...
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shell脚本读取指定文件并拼接成指定的版本信息 ...
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sed -n '4p' file | cut -d \~ -f 4 4p:第四行 \~:分隔符 4:第四列 ...
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