原文:关于SAM和广义SAM

关于SAM和广义SAM 不是教程 某些思考先记下来 SAM 终于学会了这个东西诶...... 一部分重要性质 确定一个重要事情,S构造出的SAM的一个重要性质是当且仅当对于S的任意一个后缀,可以从 号节点走到终止状态。专业的名词叫做有限状态自动机。 trans st c 表示的是对于状态st,如果将st中任意串s加一个c,那么会到达的新状态new,显然new是唯一的。假如不唯一那么s一定不属于同一 ...

2019-12-30 23:02 0 683 推荐指数:

查看详情

关于广义后缀树(多串SAM)的总结

之前我们给的SAM的例题,基本上是一个串建SAM的就能做的 如果要建多个串的SAM应该怎么做呢 首先看题,bzoj2780 我一开始的想法是SA以前的弄法,把串拼起来,中间加分隔符做SAM 这题确实可以这么做,这样根据SAM能识别所有子串的性质 而且每个节点都代表了唯一的一个串 每个 ...

Mon May 18 20:03:00 CST 2015 0 2885
SAM格式

SAM是一种序列比对格式标准, 由sanger制定,是以TAB为分割符的文本格式。主要应用于测序序列mapping到基因组上的结果表示,当然也可以表示任意的多重比对结果。 不同的软件,不同的时期,不同的研究方向,都会创建一种或者多种格式标准,当然根据当时的需要,创建符合需求的标准,也是最容易 ...

Thu Oct 25 18:13:00 CST 2012 1 8140
sam

,是一种数字移动网络,在欧洲、亚洲、非洲和世界大部分地区普遍使用。2. SAM卡(安全存取模块或安全应用 ...

Thu Jan 20 03:28:00 CST 2022 0 1202
SAM学习笔记

目录 -1.参考资料 0.定义 1.关于SAM 2.SAM 举例 3.线性构造 SAM 3.1 endpos 3.2 link 3.3 一些定义&小结 3.4 算法 4.应用 -1. ...

Tue Aug 18 05:23:00 CST 2020 6 408
SAM学习笔记

前(fei)言(hua): 咳咳,既然是学习笔记,那肯定是边学边写的啊,所以会持续更新呀。 SAM是啥子玩意?(在大佬讲之前完全听都没听过,但是根据PPT的排布以及讲的是字符串主题来看,这应该是“后缀自动机”了(本蒟蒻听过后缀自动机,仅仅只是听过,但是SAM这个名字就没听 ...

Wed Aug 19 05:15:00 CST 2020 5 232
bam/sam格式说明

SAM输出的结果中每一行都包括十二项通过Tab分隔(\t),从左到右分别是: 1 QNAME,序列的名字(Read的名字) 2 FLAG, 概括出一个合适的标记,各个数字分别代表 1 序列是一对序列中的一个 2 比对结果是一个pair-end比对的末端 ...

Fri Apr 08 17:24:00 CST 2016 0 6291
SAM 感性瞎扯

SAM 做题笔记。 这里是 SAM 感性瞎扯。 最近学了后缀自动机(Suffix_Automaton,SAM),深感其巧妙之处,故写文以记之。 部分文字与图片来源于 OI-Wiki,hihoCoder 与一些个人博客,链接在文章最底端。 在此之前请先了解有关于 SAM 的所有函数 ...

Thu Feb 18 20:37:00 CST 2021 5 141
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM