目录 基本概念 代谢组学分类与应用 代谢组学研究意义与优势 代谢组学分析流程 代谢组学常见名词 基本概念 代谢物:所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇 ...
基本概念 代谢物:所有分子量小于 Da的小分子物质,包括糖类 核苷 有机酸 酮类化合物 多肽 氨基酸 有机胺类 醛类化合物 脂质 萜类 类固醇 生物碱 小分子药物等等。 代谢组:一个细胞 组织 器官中所有代谢物的集合。 代谢组学:利用高通量的技术来鉴定和定量一个细胞 组织或器官中所有小分子或代谢物的生命科学研究。 代谢组学分类与应用 非靶向代谢组学 靶向代谢组学 研究目的 无偏向性的对所有小分子代 ...
2019-12-29 20:33 0 4434 推荐指数:
目录 基本概念 代谢组学分类与应用 代谢组学研究意义与优势 代谢组学分析流程 代谢组学常见名词 基本概念 代谢物:所有分子量小于1500Da的小分子物质,包括糖类、核苷、有机酸、酮类化合物、多肽、氨基酸、有机胺类、醛类化合物、脂质、萜类、类固醇 ...
目录 代谢物的鉴定流程 从谱图到峰表 代谢物的鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合物的鉴定就让人头疼。 流程如下: 化合物精确质量数 数据库检索 一级鉴定(筛选分子量相同的离子 ...
代谢物的鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合物的鉴定就让人头疼。 流程如下: 化合物精确质量数 数据库检索 一级鉴定(筛选分子量相同的离子)。解决质量数问题。 一级鉴定(通过同位素分布比对,筛选分子量和元素组成相同的离子)。解决 ...
目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物学原理/过程。 富集分析方法 富集分析的本质:某个代谢通路在不同的状态下(如疾病与健康)是否发生了显著变化? ORA富集 回答的问题 ...
目录 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物学原理 ...
目录 1.实验及质控 (1)项目流程 (2)非靶代谢质控 (3)靶向代谢质控 (4)代谢组全流程质控 2.数据分析挖掘 (1)代谢组分类回顾 (2)数据预处理 (3)定量层面挖掘 ...
非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。 得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。 峰表格式一般为:每行为一个m/z,每列为一个样 ...
概念 生物标志物,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药指导; 生理状态 ...