Juicer 相比其他软件还是蛮有优势的。文章中介绍突出的两个优点是(1)流程化,使用简单。(2)高性能,平行计算,对大数据友好。 Under /home/user/juicedir, ...
Hi C是高通量染色体构象捕获 High throughput Chromosome Conformation Capture, Hi C 技术的简称,开发于 年,最初用于捕获全基因组范围内所有的染色质内和染色质间的空间互作信息,目前已应用于基因表达的空间调控机制研究 构建染色体水平参考基因组 构建单体型图谱等。 样本处理:甲醛交联固定 Illumina PE 测序,质量评估,数据对比过滤,有效 ...
2019-12-19 17:27 0 1154 推荐指数:
Juicer 相比其他软件还是蛮有优势的。文章中介绍突出的两个优点是(1)流程化,使用简单。(2)高性能,平行计算,对大数据友好。 Under /home/user/juicedir, ...
1. 主要纠错类型 上篇HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错?我吐槽了Juice ...
目录 1.常用HiC挂载软件 2. Juice_box手工纠错 1.常用HiC挂载软件 ALLHiC 张兴坦老师专为多倍体和高杂合度物种基因组挂载开发。如果是复杂基因组,肯定是首选。对于简单基因组,我跑了下,结果不佳。提了issue,张老师特意开发 ...