原文:生信-使用NCBI进行目的基因的引物设计

使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计,使用了NCBI进行筛选与设计引物,使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查。本文分享了如何筛选出高质量的基因引物,帮助想通过生信进行引物设计的学生 从业者找出合适的基因,毕竟购买引物也比较烧钱,避免设计出的基因质量偏低。 NCBI查找基因 .查询目的基因:https: www.ncbi.nlm.nih.gov nu ...

2019-11-24 20:11 0 336 推荐指数:

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NCBI获取指定区域基因序列及其引物设计

获取指定基因区间序列链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000017.11 步骤一:进入NCBI主页,左边框中选择Nucleotide,并且在右边框中输入相应的搜索信息,点击Search,如下图所示:     https ...

Tue Jan 08 23:07:00 CST 2019 0 735
如何到NCBI提交基因

1 步骤和说明 NCBI官方说明 点此处打开提交基因组页面 以下例子:纯菌的基因组草图用于新菌鉴定。 1.1 提交基因组数据到 NCBI 需要什么? .fsa 格式的基因组数据; fsa 就是用公司返回的 .sqn 的数据改为 .fsa 后缀,里面是 fasta格式 ...

Thu Mar 29 22:38:00 CST 2018 0 6181
10.26-qPCR引物设计

设计原则: 1.PCR扩增产物长度 :80-150bp. 引物的产物大小不要太大,一般在80-250bp之间都可;80-150bp最为合适(可以延长至300 bp) 2.引物长度一般在15-30碱基之间。   引物长度(primer length)常用的是18-27bp,但不应大于38bp ...

Wed Oct 27 02:08:00 CST 2021 0 4994
如何从NCBI下载基因组数据

本文关于如何在 NCBI 的 FTP 里下载需要的基因组数据。 已知信息 例如:我从文献里看到作者测了 Escherichia coli ATCC 25922 的基因组,想从NCBI下载。 原文提供的信息是: This Whole Genome Shotgun ...

Fri Nov 24 17:59:00 CST 2017 0 9524
网页引物设计工具primer3的使用注意事项

进行基因定位时,有时候需要扩增某个基因的全长,查看基因在两个极端池中的突变位点,以及判断基因是否为目的基因。此时,我们需要扩增出基因的全长 因此,需要在5’端UTR和3‘端UTR区域设计引物。 以甘蓝为例,在TO1000数据库网站(http://plants.ensembl.org ...

Thu Nov 25 04:58:00 CST 2021 0 1410
 
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