原文:MetaboAnalyst的多组学分析

MetaboAnalyst是做代谢的R包,功能十分强大。也开发了web版本,代谢组学的分析这里不介绍,主要讲讲它开发的多组学分析的相关内容。 既然是做代谢的工具,即使是增加了多组学内容,肯定也是以代谢为核心。以代谢组为中心的多组学分析想想无非就是以下几点:多元变量统计分析 网络分析 pathway分析以及mGWAS或宏组学等,这个工具就有网络分析和pathway分析。下面我们一起来试试。 网络分析 ...

2019-11-22 09:56 0 2491 推荐指数:

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多组学分析及可视化R包

最近打算开始写一个多组学(包括宏基因组/16S/转录组/蛋白组/代谢组)关联分析的R包,避免重复造轮子,在开始之前随便在网上调研了下目前已有的R包工具,部分罗列如下: 1. mixOmics 应该是在多组学领域知名度最高的一个R包,有专门的团队,做了十余年了,引用量也比较高。 官网:http ...

Mon Mar 30 21:01:00 CST 2020 0 4263
代谢组学分析

综述文章 标准数据 流程样例 & 实用工具 MetaboAnalyst多组学分析 代谢组学数据质量评估 主成分分析(PCA) PLS-DA/OPLS-DA二维图 数据归一化分析 ...

Tue Jun 08 00:34:00 CST 2021 0 993
用Python学分析 - t分布

1. t分布形状类似于标准正态分布2. t分布是对称分布,较正态分布离散度强,密度曲线较标准正态分布密度曲线更扁平3. 对于大型样本,t-值与z-值之间的差别很小 作用- t分布纠正了未知的真实 ...

Fri Mar 22 23:17:00 CST 2019 0 2483
用Python学分析 - 正态分布

正态分布(Normal Distribution) 1、正态分布是一种连续分布,其函数可以在实线上的任何地方取值。 2、正态分布由两个参数描述:分布的平均值μ和方差σ2 。 3、正态分布的取值可 ...

Sat Dec 29 19:02:00 CST 2018 0 1616
学分析——常用基本极限

关于e的极限 \(\lim\limits_{x\rightarrow 0}(1+x)^\frac{1}{x} = 1\), or: \(\lim\limits_{x\rightarrow \inft ...

Sat Feb 20 01:05:00 CST 2021 0 1048
用Python学分析 - 二项分布

二项分布(Binomial Distribution)对Bernoulli试验序列的n次序列,结局A出现的次数x的概率分布服从二项分布- 两分类变量并非一定会服从二项分布- 模拟伯努利试验中n次 ...

Tue Apr 30 01:21:00 CST 2019 0 1035
学分析学习笔记

学分析学习笔记 xs,选了微积分,学的却是数分。 如果有写的不对的地方烦请指正,有些地方简写了。 自然数 皮亚诺公理: 0 是自然数 如果 \(n\) 为自然数,那么 \(S(n)\) 为自然数,\(S(n)\) 为 n 的后继,亦可以理解为 \(n ...

Fri Sep 17 01:43:00 CST 2021 0 201
学分析告诉偶们什么

看到的一篇文章,数学分析的小清新解读,自己配了些图。欢迎原作者认领。 1】人生的痛苦在于追求错误的东西。所谓追求错误的东西,就是你在无限趋近于它的时候,才猛然发现,你和它是不连续的。 2】人和人就像数轴上的有理数点,彼此可以靠得很近很近,但你们之间始终存在隔阂 ...

Thu Dec 05 04:54:00 CST 2013 3 3884
 
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