单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...
原文地址:https: doi.org . s y scSLAM seq reveals core features of transcription dynamics in single cells 摘要 单细胞转录组测序 single cell RNA seq, scRNA seq 强调了细胞间表达异质性在健康和疾病表型变异中的重要作用。然而,目前的scRNA seq方法仅仅提供了基因表达的 ...
2019-10-25 23:01 0 333 推荐指数:
单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...
方法:MALBAC方法及MDA方法,而单细胞转录组目前主要有三种方法:SMART扩增技术、10×gen ...
实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat4.0系列教程22:空间转录组的分析、可视化与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考 ...
一句话评价:小样本量单细胞转录组在冷门疾病领域应用前景尚可,常规套路也能发NC 1. Title 标题可以看出本研究的主要内容:①构建成纤维细胞的图谱/揭示成纤维细胞的异质性;②找到一群(相对于正常样本)在纤维化皮肤病中含量升高的间充质成纤维细胞 2. Background ...
什么是CNV? copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of ...
自从2009年单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术首次问世,至今已经有几十种不同的scRNA-seq技术相继被开发出来。在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展 ...
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上对转录组或基因组进行扩增并测序,以检测单细胞在基因组(结构变异-Structural Variations-SVs;拷贝数变异-Copy number variants-CNVs;单核苷酸变异-Single nucleotide variants-SNVs ...
单细胞流程跑了不少,但依旧看不懂结果,是该好好补补了。 有些人可能会误会,觉得单细胞的RNA-seq数据很好分析,跟分析常规的RNA-seq应该没什么区别。今天的这篇文章2015年3月发表在Nature Genetics Review上,专门说明了一下单细胞RNA测序数据在数据分析和计算 ...